Protein–RNA interactions for Protein: Q15404

RSU1, Ras suppressor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSU1Q15404 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RSU1Q15404 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RSU1Q15404 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RSU1Q15404 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RSU1Q15404 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RSU1Q15404 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RSU1Q15404 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RSU1Q15404 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RSU1Q15404 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RSU1Q15404 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RSU1Q15404 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RSU1Q15404 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
RSU1Q15404 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RSU1Q15404 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RSU1Q15404 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RSU1Q15404 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RSU1Q15404 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RSU1Q15404 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RSU1Q15404 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RSU1Q15404 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RSU1Q15404 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RSU1Q15404 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RSU1Q15404 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RSU1Q15404 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RSU1Q15404 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RSU1Q15404 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RSU1Q15404 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RSU1Q15404 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RSU1Q15404 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RSU1Q15404 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RSU1Q15404 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RSU1Q15404 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RSU1Q15404 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RSU1Q15404 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RSU1Q15404 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RSU1Q15404 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RSU1Q15404 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RSU1Q15404 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
RSU1Q15404 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RSU1Q15404 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RSU1Q15404 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RSU1Q15404 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RSU1Q15404 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RSU1Q15404 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RSU1Q15404 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RSU1Q15404 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RSU1Q15404 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RSU1Q15404 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RSU1Q15404 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RSU1Q15404 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
RSU1Q15404 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RSU1Q15404 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RSU1Q15404 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RSU1Q15404 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RSU1Q15404 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RSU1Q15404 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RSU1Q15404 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RSU1Q15404 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RSU1Q15404 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RSU1Q15404 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RSU1Q15404 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RSU1Q15404 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RSU1Q15404 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RSU1Q15404 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RSU1Q15404 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RSU1Q15404 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RSU1Q15404 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RSU1Q15404 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RSU1Q15404 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RSU1Q15404 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RSU1Q15404 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RSU1Q15404 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RSU1Q15404 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RSU1Q15404 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RSU1Q15404 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RSU1Q15404 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RSU1Q15404 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RSU1Q15404 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RSU1Q15404 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RSU1Q15404 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RSU1Q15404 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RSU1Q15404 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RSU1Q15404 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RSU1Q15404 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RSU1Q15404 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RSU1Q15404 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RSU1Q15404 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RSU1Q15404 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RSU1Q15404 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RSU1Q15404 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RSU1Q15404 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RSU1Q15404 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RSU1Q15404 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RSU1Q15404 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RSU1Q15404 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RSU1Q15404 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RSU1Q15404 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RSU1Q15404 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RSU1Q15404 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RSU1Q15404 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms