Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
RAB3GAP1Q15042 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
RAB3GAP1Q15042 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.87
RAB3GAP1Q15042 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
RAB3GAP1Q15042 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
RAB3GAP1Q15042 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
RAB3GAP1Q15042 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
RAB3GAP1Q15042 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
RAB3GAP1Q15042 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
RAB3GAP1Q15042 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
RAB3GAP1Q15042 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
RAB3GAP1Q15042 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
RAB3GAP1Q15042 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
RAB3GAP1Q15042 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
RAB3GAP1Q15042 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
RAB3GAP1Q15042 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
RAB3GAP1Q15042 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
RAB3GAP1Q15042 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
RAB3GAP1Q15042 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
RAB3GAP1Q15042 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
RAB3GAP1Q15042 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
RAB3GAP1Q15042 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
RAB3GAP1Q15042 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.9■■■□□ 2.86
RAB3GAP1Q15042 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
RAB3GAP1Q15042 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
RAB3GAP1Q15042 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
RAB3GAP1Q15042 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
RAB3GAP1Q15042 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
RAB3GAP1Q15042 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
RAB3GAP1Q15042 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
RAB3GAP1Q15042 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
RAB3GAP1Q15042 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
RAB3GAP1Q15042 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
RAB3GAP1Q15042 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
RAB3GAP1Q15042 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
RAB3GAP1Q15042 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
RAB3GAP1Q15042 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
RAB3GAP1Q15042 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
RAB3GAP1Q15042 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
RAB3GAP1Q15042 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
RAB3GAP1Q15042 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
RAB3GAP1Q15042 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
RAB3GAP1Q15042 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
RAB3GAP1Q15042 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
RAB3GAP1Q15042 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
RAB3GAP1Q15042 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
RAB3GAP1Q15042 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
RAB3GAP1Q15042 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
RAB3GAP1Q15042 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
RAB3GAP1Q15042 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
RAB3GAP1Q15042 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
RAB3GAP1Q15042 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
RAB3GAP1Q15042 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
RAB3GAP1Q15042 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
RAB3GAP1Q15042 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
RAB3GAP1Q15042 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
RAB3GAP1Q15042 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
RAB3GAP1Q15042 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
RAB3GAP1Q15042 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
RAB3GAP1Q15042 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
RAB3GAP1Q15042 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
RAB3GAP1Q15042 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
RAB3GAP1Q15042 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
RAB3GAP1Q15042 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
RAB3GAP1Q15042 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
RAB3GAP1Q15042 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
RAB3GAP1Q15042 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.81
RAB3GAP1Q15042 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
RAB3GAP1Q15042 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
RAB3GAP1Q15042 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
RAB3GAP1Q15042 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
RAB3GAP1Q15042 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
RAB3GAP1Q15042 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
RAB3GAP1Q15042 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
RAB3GAP1Q15042 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
RAB3GAP1Q15042 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
RAB3GAP1Q15042 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
RAB3GAP1Q15042 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
RAB3GAP1Q15042 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
RAB3GAP1Q15042 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
RAB3GAP1Q15042 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
RAB3GAP1Q15042 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
RAB3GAP1Q15042 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
RAB3GAP1Q15042 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
RAB3GAP1Q15042 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
RAB3GAP1Q15042 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
RAB3GAP1Q15042 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
RAB3GAP1Q15042 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
RAB3GAP1Q15042 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
RAB3GAP1Q15042 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
RAB3GAP1Q15042 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC32.45■■■□□ 2.78
RAB3GAP1Q15042 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
RAB3GAP1Q15042 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
RAB3GAP1Q15042 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
RAB3GAP1Q15042 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
RAB3GAP1Q15042 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
RAB3GAP1Q15042 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
RAB3GAP1Q15042 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
RAB3GAP1Q15042 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC32.42■■■□□ 2.78
RAB3GAP1Q15042 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC32.42■■■□□ 2.78
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