Protein–RNA interactions for Protein: Q14CN2

CLCA4, Calcium-activated chloride channel regulator 4, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA4Q14CN2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLCA4Q14CN2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLCA4Q14CN2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLCA4Q14CN2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLCA4Q14CN2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLCA4Q14CN2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CLCA4Q14CN2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CLCA4Q14CN2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CLCA4Q14CN2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CLCA4Q14CN2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CLCA4Q14CN2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLCA4Q14CN2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CLCA4Q14CN2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLCA4Q14CN2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLCA4Q14CN2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLCA4Q14CN2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLCA4Q14CN2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLCA4Q14CN2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLCA4Q14CN2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLCA4Q14CN2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLCA4Q14CN2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLCA4Q14CN2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CLCA4Q14CN2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CLCA4Q14CN2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CLCA4Q14CN2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CLCA4Q14CN2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLCA4Q14CN2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLCA4Q14CN2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLCA4Q14CN2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLCA4Q14CN2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLCA4Q14CN2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLCA4Q14CN2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLCA4Q14CN2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLCA4Q14CN2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLCA4Q14CN2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLCA4Q14CN2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLCA4Q14CN2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLCA4Q14CN2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLCA4Q14CN2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLCA4Q14CN2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLCA4Q14CN2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLCA4Q14CN2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLCA4Q14CN2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLCA4Q14CN2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLCA4Q14CN2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CLCA4Q14CN2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CLCA4Q14CN2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLCA4Q14CN2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLCA4Q14CN2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLCA4Q14CN2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLCA4Q14CN2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLCA4Q14CN2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLCA4Q14CN2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CLCA4Q14CN2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CLCA4Q14CN2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLCA4Q14CN2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLCA4Q14CN2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLCA4Q14CN2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLCA4Q14CN2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLCA4Q14CN2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CLCA4Q14CN2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLCA4Q14CN2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLCA4Q14CN2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLCA4Q14CN2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLCA4Q14CN2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLCA4Q14CN2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLCA4Q14CN2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLCA4Q14CN2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLCA4Q14CN2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLCA4Q14CN2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLCA4Q14CN2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLCA4Q14CN2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CLCA4Q14CN2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLCA4Q14CN2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLCA4Q14CN2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLCA4Q14CN2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLCA4Q14CN2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CLCA4Q14CN2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CLCA4Q14CN2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CLCA4Q14CN2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CLCA4Q14CN2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CLCA4Q14CN2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CLCA4Q14CN2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CLCA4Q14CN2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CLCA4Q14CN2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CLCA4Q14CN2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CLCA4Q14CN2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CLCA4Q14CN2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CLCA4Q14CN2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLCA4Q14CN2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLCA4Q14CN2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLCA4Q14CN2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CLCA4Q14CN2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CLCA4Q14CN2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLCA4Q14CN2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLCA4Q14CN2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLCA4Q14CN2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLCA4Q14CN2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLCA4Q14CN2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLCA4Q14CN2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
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