Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SSPNQ14714 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SSPNQ14714 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SSPNQ14714 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SSPNQ14714 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SSPNQ14714 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SSPNQ14714 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SSPNQ14714 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SSPNQ14714 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SSPNQ14714 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SSPNQ14714 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SSPNQ14714 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SSPNQ14714 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SSPNQ14714 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SSPNQ14714 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SSPNQ14714 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SSPNQ14714 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SSPNQ14714 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SSPNQ14714 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SSPNQ14714 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SSPNQ14714 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SSPNQ14714 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SSPNQ14714 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SSPNQ14714 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SSPNQ14714 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SSPNQ14714 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SSPNQ14714 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SSPNQ14714 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SSPNQ14714 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SSPNQ14714 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SSPNQ14714 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SSPNQ14714 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SSPNQ14714 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SSPNQ14714 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SSPNQ14714 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SSPNQ14714 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SSPNQ14714 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SSPNQ14714 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SSPNQ14714 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SSPNQ14714 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SSPNQ14714 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SSPNQ14714 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SSPNQ14714 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SSPNQ14714 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SSPNQ14714 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SSPNQ14714 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SSPNQ14714 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SSPNQ14714 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SSPNQ14714 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SSPNQ14714 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SSPNQ14714 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SSPNQ14714 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SSPNQ14714 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SSPNQ14714 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SSPNQ14714 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SSPNQ14714 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SSPNQ14714 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SSPNQ14714 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SSPNQ14714 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SSPNQ14714 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SSPNQ14714 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SSPNQ14714 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SSPNQ14714 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SSPNQ14714 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SSPNQ14714 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SSPNQ14714 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SSPNQ14714 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SSPNQ14714 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SSPNQ14714 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SSPNQ14714 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SSPNQ14714 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SSPNQ14714 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SSPNQ14714 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SSPNQ14714 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SSPNQ14714 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SSPNQ14714 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SSPNQ14714 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SSPNQ14714 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SSPNQ14714 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SSPNQ14714 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SSPNQ14714 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SSPNQ14714 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SSPNQ14714 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SSPNQ14714 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SSPNQ14714 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SSPNQ14714 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SSPNQ14714 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SSPNQ14714 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SSPNQ14714 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SSPNQ14714 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SSPNQ14714 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SSPNQ14714 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SSPNQ14714 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SSPNQ14714 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SSPNQ14714 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SSPNQ14714 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SSPNQ14714 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SSPNQ14714 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SSPNQ14714 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SSPNQ14714 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
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