Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

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Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SQLEQ14534 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SQLEQ14534 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SQLEQ14534 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SQLEQ14534 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SQLEQ14534 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SQLEQ14534 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SQLEQ14534 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SQLEQ14534 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SQLEQ14534 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SQLEQ14534 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SQLEQ14534 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SQLEQ14534 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SQLEQ14534 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SQLEQ14534 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SQLEQ14534 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SQLEQ14534 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SQLEQ14534 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SQLEQ14534 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SQLEQ14534 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SQLEQ14534 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.08■■□□□ 1.76
SQLEQ14534 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SQLEQ14534 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SQLEQ14534 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SQLEQ14534 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SQLEQ14534 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SQLEQ14534 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SQLEQ14534 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SQLEQ14534 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SQLEQ14534 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SQLEQ14534 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SQLEQ14534 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SQLEQ14534 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SQLEQ14534 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SQLEQ14534 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SQLEQ14534 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SQLEQ14534 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SQLEQ14534 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SQLEQ14534 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SQLEQ14534 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SQLEQ14534 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SQLEQ14534 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SQLEQ14534 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SQLEQ14534 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SQLEQ14534 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SQLEQ14534 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SQLEQ14534 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SQLEQ14534 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SQLEQ14534 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SQLEQ14534 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SQLEQ14534 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SQLEQ14534 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SQLEQ14534 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SQLEQ14534 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SQLEQ14534 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SQLEQ14534 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SQLEQ14534 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SQLEQ14534 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SQLEQ14534 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SQLEQ14534 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SQLEQ14534 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SQLEQ14534 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SQLEQ14534 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SQLEQ14534 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SQLEQ14534 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SQLEQ14534 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SQLEQ14534 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SQLEQ14534 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SQLEQ14534 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SQLEQ14534 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SQLEQ14534 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SQLEQ14534 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SQLEQ14534 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SQLEQ14534 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SQLEQ14534 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SQLEQ14534 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SQLEQ14534 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SQLEQ14534 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SQLEQ14534 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SQLEQ14534 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SQLEQ14534 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SQLEQ14534 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SQLEQ14534 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SQLEQ14534 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SQLEQ14534 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SQLEQ14534 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SQLEQ14534 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SQLEQ14534 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SQLEQ14534 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SQLEQ14534 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SQLEQ14534 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SQLEQ14534 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SQLEQ14534 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SQLEQ14534 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SQLEQ14534 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SQLEQ14534 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SQLEQ14534 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SQLEQ14534 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SQLEQ14534 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SQLEQ14534 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
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