Protein–RNA interactions for Protein: Q14498

RBM39, RNA-binding protein 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39Q14498 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RBM39Q14498 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RBM39Q14498 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RBM39Q14498 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RBM39Q14498 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RBM39Q14498 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RBM39Q14498 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RBM39Q14498 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RBM39Q14498 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RBM39Q14498 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RBM39Q14498 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RBM39Q14498 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RBM39Q14498 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RBM39Q14498 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RBM39Q14498 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBM39Q14498 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RBM39Q14498 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RBM39Q14498 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RBM39Q14498 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RBM39Q14498 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RBM39Q14498 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RBM39Q14498 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBM39Q14498 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBM39Q14498 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBM39Q14498 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBM39Q14498 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RBM39Q14498 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RBM39Q14498 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RBM39Q14498 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RBM39Q14498 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RBM39Q14498 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RBM39Q14498 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RBM39Q14498 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBM39Q14498 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBM39Q14498 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBM39Q14498 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RBM39Q14498 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RBM39Q14498 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RBM39Q14498 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RBM39Q14498 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RBM39Q14498 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RBM39Q14498 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RBM39Q14498 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RBM39Q14498 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
RBM39Q14498 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RBM39Q14498 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBM39Q14498 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBM39Q14498 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBM39Q14498 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBM39Q14498 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBM39Q14498 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBM39Q14498 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBM39Q14498 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBM39Q14498 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBM39Q14498 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBM39Q14498 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBM39Q14498 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBM39Q14498 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBM39Q14498 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBM39Q14498 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBM39Q14498 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RBM39Q14498 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RBM39Q14498 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBM39Q14498 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBM39Q14498 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBM39Q14498 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBM39Q14498 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBM39Q14498 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBM39Q14498 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBM39Q14498 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBM39Q14498 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBM39Q14498 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBM39Q14498 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBM39Q14498 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBM39Q14498 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBM39Q14498 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBM39Q14498 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBM39Q14498 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBM39Q14498 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RBM39Q14498 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBM39Q14498 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBM39Q14498 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBM39Q14498 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBM39Q14498 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBM39Q14498 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBM39Q14498 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RBM39Q14498 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RBM39Q14498 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RBM39Q14498 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RBM39Q14498 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RBM39Q14498 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBM39Q14498 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBM39Q14498 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBM39Q14498 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBM39Q14498 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBM39Q14498 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBM39Q14498 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBM39Q14498 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBM39Q14498 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBM39Q14498 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
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