Protein–RNA interactions for Protein: Q13621

SLC12A1, Solute carrier family 12 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,099 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A1Q13621 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC12A1Q13621 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC12A1Q13621 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC12A1Q13621 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC12A1Q13621 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC12A1Q13621 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC12A1Q13621 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC12A1Q13621 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC12A1Q13621 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC12A1Q13621 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC12A1Q13621 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC12A1Q13621 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC12A1Q13621 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC12A1Q13621 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC12A1Q13621 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC12A1Q13621 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC12A1Q13621 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC12A1Q13621 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC12A1Q13621 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC12A1Q13621 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC12A1Q13621 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC12A1Q13621 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC12A1Q13621 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC12A1Q13621 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC12A1Q13621 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC12A1Q13621 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC12A1Q13621 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC12A1Q13621 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC12A1Q13621 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC12A1Q13621 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC12A1Q13621 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC12A1Q13621 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC12A1Q13621 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLC12A1Q13621 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SLC12A1Q13621 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC12A1Q13621 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC12A1Q13621 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC12A1Q13621 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC12A1Q13621 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC12A1Q13621 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC12A1Q13621 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLC12A1Q13621 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLC12A1Q13621 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC12A1Q13621 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC12A1Q13621 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC12A1Q13621 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC12A1Q13621 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC12A1Q13621 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC12A1Q13621 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC12A1Q13621 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC12A1Q13621 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC12A1Q13621 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC12A1Q13621 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC12A1Q13621 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC12A1Q13621 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC12A1Q13621 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC12A1Q13621 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC12A1Q13621 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC12A1Q13621 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
SLC12A1Q13621 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SLC12A1Q13621 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC12A1Q13621 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC12A1Q13621 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC12A1Q13621 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC12A1Q13621 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC12A1Q13621 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC12A1Q13621 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC12A1Q13621 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC12A1Q13621 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC12A1Q13621 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC12A1Q13621 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC12A1Q13621 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC12A1Q13621 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC12A1Q13621 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC12A1Q13621 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC12A1Q13621 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC12A1Q13621 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC12A1Q13621 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC12A1Q13621 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC12A1Q13621 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC12A1Q13621 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC12A1Q13621 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC12A1Q13621 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC12A1Q13621 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC12A1Q13621 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC12A1Q13621 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC12A1Q13621 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC12A1Q13621 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLC12A1Q13621 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SLC12A1Q13621 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLC12A1Q13621 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLC12A1Q13621 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SLC12A1Q13621 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLC12A1Q13621 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLC12A1Q13621 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLC12A1Q13621 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
SLC12A1Q13621 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SLC12A1Q13621 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SLC12A1Q13621 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
SLC12A1Q13621 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms