Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
FOXE3Q13461 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FOXE3Q13461 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FOXE3Q13461 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FOXE3Q13461 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FOXE3Q13461 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FOXE3Q13461 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FOXE3Q13461 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FOXE3Q13461 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FOXE3Q13461 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FOXE3Q13461 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FOXE3Q13461 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FOXE3Q13461 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FOXE3Q13461 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FOXE3Q13461 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FOXE3Q13461 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXE3Q13461 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXE3Q13461 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXE3Q13461 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXE3Q13461 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXE3Q13461 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXE3Q13461 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXE3Q13461 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXE3Q13461 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXE3Q13461 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXE3Q13461 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXE3Q13461 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXE3Q13461 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXE3Q13461 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXE3Q13461 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FOXE3Q13461 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FOXE3Q13461 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FOXE3Q13461 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
FOXE3Q13461 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FOXE3Q13461 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXE3Q13461 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXE3Q13461 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXE3Q13461 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXE3Q13461 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FOXE3Q13461 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FOXE3Q13461 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOXE3Q13461 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOXE3Q13461 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOXE3Q13461 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOXE3Q13461 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOXE3Q13461 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOXE3Q13461 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FOXE3Q13461 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOXE3Q13461 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOXE3Q13461 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOXE3Q13461 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOXE3Q13461 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FOXE3Q13461 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FOXE3Q13461 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FOXE3Q13461 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
FOXE3Q13461 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOXE3Q13461 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOXE3Q13461 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FOXE3Q13461 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FOXE3Q13461 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FOXE3Q13461 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
FOXE3Q13461 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FOXE3Q13461 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FOXE3Q13461 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
FOXE3Q13461 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FOXE3Q13461 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FOXE3Q13461 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FOXE3Q13461 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FOXE3Q13461 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
FOXE3Q13461 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
FOXE3Q13461 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOXE3Q13461 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
FOXE3Q13461 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOXE3Q13461 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FOXE3Q13461 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
FOXE3Q13461 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FOXE3Q13461 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FOXE3Q13461 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FOXE3Q13461 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FOXE3Q13461 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FOXE3Q13461 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FOXE3Q13461 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FOXE3Q13461 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXE3Q13461 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXE3Q13461 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXE3Q13461 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FOXE3Q13461 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FOXE3Q13461 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FOXE3Q13461 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FOXE3Q13461 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FOXE3Q13461 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
FOXE3Q13461 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FOXE3Q13461 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FOXE3Q13461 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FOXE3Q13461 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FOXE3Q13461 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FOXE3Q13461 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FOXE3Q13461 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FOXE3Q13461 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FOXE3Q13461 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
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