Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CBX3Q13185 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CBX3Q13185 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CBX3Q13185 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CBX3Q13185 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CBX3Q13185 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CBX3Q13185 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CBX3Q13185 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CBX3Q13185 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CBX3Q13185 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CBX3Q13185 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CBX3Q13185 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CBX3Q13185 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CBX3Q13185 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CBX3Q13185 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CBX3Q13185 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CBX3Q13185 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CBX3Q13185 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CBX3Q13185 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CBX3Q13185 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CBX3Q13185 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CBX3Q13185 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CBX3Q13185 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CBX3Q13185 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CBX3Q13185 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CBX3Q13185 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CBX3Q13185 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CBX3Q13185 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CBX3Q13185 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CBX3Q13185 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CBX3Q13185 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CBX3Q13185 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CBX3Q13185 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CBX3Q13185 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CBX3Q13185 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CBX3Q13185 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CBX3Q13185 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CBX3Q13185 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CBX3Q13185 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CBX3Q13185 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CBX3Q13185 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CBX3Q13185 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CBX3Q13185 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CBX3Q13185 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CBX3Q13185 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CBX3Q13185 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CBX3Q13185 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CBX3Q13185 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CBX3Q13185 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CBX3Q13185 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CBX3Q13185 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CBX3Q13185 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CBX3Q13185 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CBX3Q13185 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CBX3Q13185 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CBX3Q13185 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CBX3Q13185 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CBX3Q13185 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CBX3Q13185 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CBX3Q13185 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CBX3Q13185 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CBX3Q13185 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CBX3Q13185 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CBX3Q13185 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CBX3Q13185 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CBX3Q13185 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CBX3Q13185 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CBX3Q13185 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CBX3Q13185 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CBX3Q13185 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CBX3Q13185 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CBX3Q13185 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CBX3Q13185 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CBX3Q13185 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CBX3Q13185 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CBX3Q13185 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CBX3Q13185 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CBX3Q13185 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CBX3Q13185 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CBX3Q13185 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CBX3Q13185 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CBX3Q13185 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CBX3Q13185 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CBX3Q13185 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CBX3Q13185 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CBX3Q13185 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CBX3Q13185 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CBX3Q13185 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CBX3Q13185 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CBX3Q13185 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CBX3Q13185 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CBX3Q13185 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CBX3Q13185 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CBX3Q13185 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CBX3Q13185 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CBX3Q13185 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CBX3Q13185 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CBX3Q13185 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CBX3Q13185 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CBX3Q13185 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
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