Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF3C1Q12789 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF3C1Q12789 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF3C1Q12789 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF3C1Q12789 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF3C1Q12789 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF3C1Q12789 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF3C1Q12789 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF3C1Q12789 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF3C1Q12789 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF3C1Q12789 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF3C1Q12789 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF3C1Q12789 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF3C1Q12789 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF3C1Q12789 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF3C1Q12789 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF3C1Q12789 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF3C1Q12789 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF3C1Q12789 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF3C1Q12789 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF3C1Q12789 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF3C1Q12789 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF3C1Q12789 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF3C1Q12789 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF3C1Q12789 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF3C1Q12789 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF3C1Q12789 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF3C1Q12789 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF3C1Q12789 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF3C1Q12789 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GTF3C1Q12789 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GTF3C1Q12789 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF3C1Q12789 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF3C1Q12789 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF3C1Q12789 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF3C1Q12789 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF3C1Q12789 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF3C1Q12789 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF3C1Q12789 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF3C1Q12789 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF3C1Q12789 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF3C1Q12789 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF3C1Q12789 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF3C1Q12789 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF3C1Q12789 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GTF3C1Q12789 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GTF3C1Q12789 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF3C1Q12789 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF3C1Q12789 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF3C1Q12789 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF3C1Q12789 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF3C1Q12789 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF3C1Q12789 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF3C1Q12789 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF3C1Q12789 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF3C1Q12789 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF3C1Q12789 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF3C1Q12789 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF3C1Q12789 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF3C1Q12789 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF3C1Q12789 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF3C1Q12789 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF3C1Q12789 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF3C1Q12789 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF3C1Q12789 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF3C1Q12789 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF3C1Q12789 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF3C1Q12789 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF3C1Q12789 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF3C1Q12789 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF3C1Q12789 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF3C1Q12789 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF3C1Q12789 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF3C1Q12789 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF3C1Q12789 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF3C1Q12789 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF3C1Q12789 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF3C1Q12789 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF3C1Q12789 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF3C1Q12789 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF3C1Q12789 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF3C1Q12789 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF3C1Q12789 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF3C1Q12789 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF3C1Q12789 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF3C1Q12789 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF3C1Q12789 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF3C1Q12789 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF3C1Q12789 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF3C1Q12789 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF3C1Q12789 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF3C1Q12789 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF3C1Q12789 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF3C1Q12789 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GTF3C1Q12789 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GTF3C1Q12789 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GTF3C1Q12789 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GTF3C1Q12789 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF3C1Q12789 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF3C1Q12789 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
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