Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYCNQ0VAF6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYCNQ0VAF6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYCNQ0VAF6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYCNQ0VAF6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYCNQ0VAF6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYCNQ0VAF6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYCNQ0VAF6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYCNQ0VAF6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYCNQ0VAF6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYCNQ0VAF6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYCNQ0VAF6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYCNQ0VAF6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYCNQ0VAF6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYCNQ0VAF6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYCNQ0VAF6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYCNQ0VAF6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYCNQ0VAF6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYCNQ0VAF6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYCNQ0VAF6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYCNQ0VAF6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYCNQ0VAF6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYCNQ0VAF6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SYCNQ0VAF6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYCNQ0VAF6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYCNQ0VAF6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYCNQ0VAF6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYCNQ0VAF6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYCNQ0VAF6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYCNQ0VAF6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYCNQ0VAF6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYCNQ0VAF6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYCNQ0VAF6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYCNQ0VAF6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYCNQ0VAF6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYCNQ0VAF6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYCNQ0VAF6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYCNQ0VAF6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYCNQ0VAF6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYCNQ0VAF6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYCNQ0VAF6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYCNQ0VAF6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYCNQ0VAF6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYCNQ0VAF6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYCNQ0VAF6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYCNQ0VAF6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYCNQ0VAF6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYCNQ0VAF6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYCNQ0VAF6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYCNQ0VAF6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYCNQ0VAF6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SYCNQ0VAF6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SYCNQ0VAF6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SYCNQ0VAF6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SYCNQ0VAF6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SYCNQ0VAF6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SYCNQ0VAF6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SYCNQ0VAF6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SYCNQ0VAF6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SYCNQ0VAF6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SYCNQ0VAF6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SYCNQ0VAF6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SYCNQ0VAF6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYCNQ0VAF6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYCNQ0VAF6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYCNQ0VAF6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYCNQ0VAF6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYCNQ0VAF6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYCNQ0VAF6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYCNQ0VAF6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYCNQ0VAF6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SYCNQ0VAF6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYCNQ0VAF6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYCNQ0VAF6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYCNQ0VAF6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYCNQ0VAF6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYCNQ0VAF6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYCNQ0VAF6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYCNQ0VAF6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYCNQ0VAF6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SYCNQ0VAF6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYCNQ0VAF6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYCNQ0VAF6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYCNQ0VAF6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYCNQ0VAF6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYCNQ0VAF6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYCNQ0VAF6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYCNQ0VAF6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SYCNQ0VAF6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
SYCNQ0VAF6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYCNQ0VAF6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYCNQ0VAF6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYCNQ0VAF6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYCNQ0VAF6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYCNQ0VAF6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYCNQ0VAF6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYCNQ0VAF6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYCNQ0VAF6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYCNQ0VAF6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYCNQ0VAF6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms