Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC15Q0P6D6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC15Q0P6D6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC15Q0P6D6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC15Q0P6D6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC15Q0P6D6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC15Q0P6D6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC15Q0P6D6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC15Q0P6D6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC15Q0P6D6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC15Q0P6D6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC15Q0P6D6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC15Q0P6D6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CCDC15Q0P6D6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC15Q0P6D6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC15Q0P6D6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC15Q0P6D6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC15Q0P6D6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC15Q0P6D6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC15Q0P6D6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC15Q0P6D6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC15Q0P6D6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC15Q0P6D6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC15Q0P6D6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC15Q0P6D6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC15Q0P6D6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC15Q0P6D6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC15Q0P6D6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC15Q0P6D6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC15Q0P6D6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC15Q0P6D6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC15Q0P6D6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC15Q0P6D6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC15Q0P6D6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC15Q0P6D6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC15Q0P6D6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC15Q0P6D6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC15Q0P6D6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC15Q0P6D6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC15Q0P6D6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC15Q0P6D6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC15Q0P6D6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCDC15Q0P6D6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCDC15Q0P6D6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC15Q0P6D6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC15Q0P6D6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC15Q0P6D6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC15Q0P6D6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC15Q0P6D6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC15Q0P6D6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC15Q0P6D6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC15Q0P6D6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC15Q0P6D6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC15Q0P6D6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC15Q0P6D6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC15Q0P6D6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC15Q0P6D6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC15Q0P6D6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC15Q0P6D6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC15Q0P6D6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC15Q0P6D6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC15Q0P6D6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC15Q0P6D6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC15Q0P6D6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC15Q0P6D6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC15Q0P6D6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC15Q0P6D6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC15Q0P6D6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC15Q0P6D6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC15Q0P6D6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC15Q0P6D6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CCDC15Q0P6D6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC15Q0P6D6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC15Q0P6D6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC15Q0P6D6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CCDC15Q0P6D6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC15Q0P6D6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC15Q0P6D6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC15Q0P6D6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CCDC15Q0P6D6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC15Q0P6D6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC15Q0P6D6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC15Q0P6D6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC15Q0P6D6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC15Q0P6D6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC15Q0P6D6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC15Q0P6D6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC15Q0P6D6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC15Q0P6D6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC15Q0P6D6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC15Q0P6D6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC15Q0P6D6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC15Q0P6D6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC15Q0P6D6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC15Q0P6D6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC15Q0P6D6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC15Q0P6D6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC15Q0P6D6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC15Q0P6D6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC15Q0P6D6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms