Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NCBP1Q09161 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NCBP1Q09161 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NCBP1Q09161 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
NCBP1Q09161 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
NCBP1Q09161 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NCBP1Q09161 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NCBP1Q09161 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NCBP1Q09161 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
NCBP1Q09161 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
NCBP1Q09161 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
NCBP1Q09161 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NCBP1Q09161 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
NCBP1Q09161 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
NCBP1Q09161 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
NCBP1Q09161 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NCBP1Q09161 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
NCBP1Q09161 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
NCBP1Q09161 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NCBP1Q09161 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
NCBP1Q09161 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
NCBP1Q09161 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
NCBP1Q09161 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
NCBP1Q09161 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
NCBP1Q09161 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
NCBP1Q09161 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
NCBP1Q09161 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
NCBP1Q09161 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
NCBP1Q09161 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
NCBP1Q09161 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
NCBP1Q09161 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
NCBP1Q09161 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
NCBP1Q09161 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
NCBP1Q09161 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NCBP1Q09161 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
NCBP1Q09161 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
NCBP1Q09161 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NCBP1Q09161 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
NCBP1Q09161 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
NCBP1Q09161 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
NCBP1Q09161 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
NCBP1Q09161 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
NCBP1Q09161 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
NCBP1Q09161 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
NCBP1Q09161 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
NCBP1Q09161 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
NCBP1Q09161 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
NCBP1Q09161 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC30.2■■■□□ 2.42
NCBP1Q09161 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NCBP1Q09161 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NCBP1Q09161 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
NCBP1Q09161 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
NCBP1Q09161 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NCBP1Q09161 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NCBP1Q09161 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
NCBP1Q09161 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
NCBP1Q09161 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NCBP1Q09161 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NCBP1Q09161 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NCBP1Q09161 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NCBP1Q09161 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NCBP1Q09161 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NCBP1Q09161 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NCBP1Q09161 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NCBP1Q09161 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NCBP1Q09161 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NCBP1Q09161 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
NCBP1Q09161 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
NCBP1Q09161 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NCBP1Q09161 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NCBP1Q09161 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NCBP1Q09161 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NCBP1Q09161 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NCBP1Q09161 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
NCBP1Q09161 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NCBP1Q09161 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
NCBP1Q09161 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NCBP1Q09161 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NCBP1Q09161 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NCBP1Q09161 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NCBP1Q09161 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NCBP1Q09161 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NCBP1Q09161 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NCBP1Q09161 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NCBP1Q09161 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
NCBP1Q09161 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
NCBP1Q09161 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
NCBP1Q09161 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NCBP1Q09161 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NCBP1Q09161 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NCBP1Q09161 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NCBP1Q09161 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
NCBP1Q09161 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NCBP1Q09161 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NCBP1Q09161 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
NCBP1Q09161 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
NCBP1Q09161 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
NCBP1Q09161 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
NCBP1Q09161 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NCBP1Q09161 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms