Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PUDPQ08623 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PUDPQ08623 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PUDPQ08623 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PUDPQ08623 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PUDPQ08623 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PUDPQ08623 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PUDPQ08623 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PUDPQ08623 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PUDPQ08623 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PUDPQ08623 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PUDPQ08623 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PUDPQ08623 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PUDPQ08623 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PUDPQ08623 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PUDPQ08623 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PUDPQ08623 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PUDPQ08623 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PUDPQ08623 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PUDPQ08623 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PUDPQ08623 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PUDPQ08623 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PUDPQ08623 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PUDPQ08623 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PUDPQ08623 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PUDPQ08623 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PUDPQ08623 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PUDPQ08623 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PUDPQ08623 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PUDPQ08623 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PUDPQ08623 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PUDPQ08623 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PUDPQ08623 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PUDPQ08623 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PUDPQ08623 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PUDPQ08623 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PUDPQ08623 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PUDPQ08623 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PUDPQ08623 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PUDPQ08623 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PUDPQ08623 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PUDPQ08623 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PUDPQ08623 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PUDPQ08623 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PUDPQ08623 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PUDPQ08623 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PUDPQ08623 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PUDPQ08623 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PUDPQ08623 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PUDPQ08623 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PUDPQ08623 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PUDPQ08623 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PUDPQ08623 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PUDPQ08623 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PUDPQ08623 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PUDPQ08623 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PUDPQ08623 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PUDPQ08623 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PUDPQ08623 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PUDPQ08623 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PUDPQ08623 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PUDPQ08623 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PUDPQ08623 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PUDPQ08623 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PUDPQ08623 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PUDPQ08623 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PUDPQ08623 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PUDPQ08623 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PUDPQ08623 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PUDPQ08623 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PUDPQ08623 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PUDPQ08623 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PUDPQ08623 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PUDPQ08623 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PUDPQ08623 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PUDPQ08623 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PUDPQ08623 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PUDPQ08623 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PUDPQ08623 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PUDPQ08623 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PUDPQ08623 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PUDPQ08623 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PUDPQ08623 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PUDPQ08623 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PUDPQ08623 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PUDPQ08623 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PUDPQ08623 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PUDPQ08623 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PUDPQ08623 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PUDPQ08623 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PUDPQ08623 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PUDPQ08623 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PUDPQ08623 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PUDPQ08623 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PUDPQ08623 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PUDPQ08623 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PUDPQ08623 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PUDPQ08623 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PUDPQ08623 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PUDPQ08623 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms