Protein–RNA interactions for Protein: Q07021

C1QBP, Complement component 1 Q subcomponent-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QBPQ07021 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
C1QBPQ07021 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
C1QBPQ07021 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
C1QBPQ07021 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
C1QBPQ07021 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
C1QBPQ07021 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
C1QBPQ07021 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
C1QBPQ07021 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
C1QBPQ07021 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
C1QBPQ07021 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
C1QBPQ07021 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
C1QBPQ07021 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
C1QBPQ07021 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
C1QBPQ07021 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
C1QBPQ07021 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
C1QBPQ07021 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
C1QBPQ07021 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
C1QBPQ07021 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
C1QBPQ07021 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
C1QBPQ07021 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
C1QBPQ07021 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
C1QBPQ07021 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
C1QBPQ07021 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
C1QBPQ07021 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
C1QBPQ07021 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
C1QBPQ07021 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
C1QBPQ07021 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
C1QBPQ07021 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
C1QBPQ07021 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
C1QBPQ07021 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
C1QBPQ07021 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
C1QBPQ07021 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
C1QBPQ07021 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
C1QBPQ07021 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
C1QBPQ07021 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
C1QBPQ07021 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
C1QBPQ07021 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
C1QBPQ07021 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
C1QBPQ07021 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
C1QBPQ07021 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
C1QBPQ07021 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
C1QBPQ07021 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
C1QBPQ07021 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
C1QBPQ07021 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
C1QBPQ07021 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
C1QBPQ07021 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
C1QBPQ07021 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
C1QBPQ07021 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
C1QBPQ07021 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
C1QBPQ07021 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
C1QBPQ07021 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
C1QBPQ07021 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
C1QBPQ07021 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
C1QBPQ07021 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
C1QBPQ07021 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
C1QBPQ07021 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
C1QBPQ07021 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
C1QBPQ07021 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
C1QBPQ07021 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
C1QBPQ07021 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
C1QBPQ07021 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
C1QBPQ07021 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
C1QBPQ07021 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
C1QBPQ07021 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
C1QBPQ07021 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
C1QBPQ07021 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
C1QBPQ07021 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
C1QBPQ07021 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
C1QBPQ07021 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
C1QBPQ07021 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
C1QBPQ07021 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
C1QBPQ07021 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
C1QBPQ07021 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
C1QBPQ07021 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
C1QBPQ07021 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
C1QBPQ07021 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
C1QBPQ07021 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
C1QBPQ07021 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
C1QBPQ07021 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
C1QBPQ07021 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
C1QBPQ07021 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
C1QBPQ07021 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
C1QBPQ07021 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
C1QBPQ07021 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
C1QBPQ07021 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
C1QBPQ07021 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
C1QBPQ07021 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
C1QBPQ07021 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
C1QBPQ07021 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
C1QBPQ07021 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
C1QBPQ07021 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
C1QBPQ07021 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
C1QBPQ07021 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
C1QBPQ07021 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
C1QBPQ07021 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
C1QBPQ07021 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
C1QBPQ07021 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
C1QBPQ07021 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
C1QBPQ07021 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
C1QBPQ07021 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms