Protein–RNA interactions for Protein: Q07020

RPL18, 60S ribosomal protein L18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL18Q07020 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPL18Q07020 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPL18Q07020 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPL18Q07020 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RPL18Q07020 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPL18Q07020 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPL18Q07020 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPL18Q07020 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPL18Q07020 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPL18Q07020 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPL18Q07020 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPL18Q07020 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPL18Q07020 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPL18Q07020 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPL18Q07020 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPL18Q07020 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPL18Q07020 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPL18Q07020 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPL18Q07020 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPL18Q07020 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPL18Q07020 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPL18Q07020 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPL18Q07020 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPL18Q07020 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPL18Q07020 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPL18Q07020 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPL18Q07020 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPL18Q07020 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPL18Q07020 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPL18Q07020 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RPL18Q07020 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPL18Q07020 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPL18Q07020 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RPL18Q07020 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPL18Q07020 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPL18Q07020 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPL18Q07020 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPL18Q07020 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPL18Q07020 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPL18Q07020 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPL18Q07020 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPL18Q07020 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPL18Q07020 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPL18Q07020 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPL18Q07020 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPL18Q07020 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPL18Q07020 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RPL18Q07020 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPL18Q07020 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPL18Q07020 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPL18Q07020 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPL18Q07020 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPL18Q07020 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RPL18Q07020 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPL18Q07020 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPL18Q07020 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RPL18Q07020 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPL18Q07020 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPL18Q07020 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPL18Q07020 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPL18Q07020 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPL18Q07020 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPL18Q07020 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPL18Q07020 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPL18Q07020 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPL18Q07020 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPL18Q07020 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RPL18Q07020 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPL18Q07020 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPL18Q07020 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPL18Q07020 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPL18Q07020 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPL18Q07020 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPL18Q07020 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPL18Q07020 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPL18Q07020 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPL18Q07020 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPL18Q07020 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPL18Q07020 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RPL18Q07020 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPL18Q07020 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPL18Q07020 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPL18Q07020 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPL18Q07020 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPL18Q07020 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPL18Q07020 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPL18Q07020 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPL18Q07020 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPL18Q07020 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RPL18Q07020 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPL18Q07020 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPL18Q07020 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPL18Q07020 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPL18Q07020 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPL18Q07020 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPL18Q07020 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPL18Q07020 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPL18Q07020 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPL18Q07020 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPL18Q07020 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms