Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LTBQ06643 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LTBQ06643 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LTBQ06643 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LTBQ06643 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LTBQ06643 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LTBQ06643 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LTBQ06643 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LTBQ06643 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LTBQ06643 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LTBQ06643 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LTBQ06643 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LTBQ06643 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LTBQ06643 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LTBQ06643 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LTBQ06643 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LTBQ06643 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LTBQ06643 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LTBQ06643 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LTBQ06643 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LTBQ06643 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
LTBQ06643 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LTBQ06643 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LTBQ06643 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LTBQ06643 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LTBQ06643 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LTBQ06643 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LTBQ06643 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LTBQ06643 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LTBQ06643 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LTBQ06643 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LTBQ06643 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LTBQ06643 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LTBQ06643 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LTBQ06643 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LTBQ06643 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
LTBQ06643 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LTBQ06643 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LTBQ06643 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LTBQ06643 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LTBQ06643 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LTBQ06643 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LTBQ06643 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LTBQ06643 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LTBQ06643 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LTBQ06643 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LTBQ06643 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LTBQ06643 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LTBQ06643 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LTBQ06643 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LTBQ06643 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LTBQ06643 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LTBQ06643 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LTBQ06643 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LTBQ06643 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LTBQ06643 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LTBQ06643 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LTBQ06643 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LTBQ06643 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LTBQ06643 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LTBQ06643 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LTBQ06643 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LTBQ06643 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LTBQ06643 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LTBQ06643 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LTBQ06643 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LTBQ06643 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LTBQ06643 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LTBQ06643 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LTBQ06643 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LTBQ06643 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LTBQ06643 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LTBQ06643 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LTBQ06643 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LTBQ06643 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LTBQ06643 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LTBQ06643 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LTBQ06643 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LTBQ06643 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LTBQ06643 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LTBQ06643 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LTBQ06643 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LTBQ06643 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LTBQ06643 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LTBQ06643 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LTBQ06643 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LTBQ06643 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LTBQ06643 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LTBQ06643 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LTBQ06643 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LTBQ06643 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LTBQ06643 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LTBQ06643 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LTBQ06643 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LTBQ06643 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LTBQ06643 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LTBQ06643 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LTBQ06643 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LTBQ06643 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LTBQ06643 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms