Protein–RNA interactions for Protein: Q06136

KDSR, 3-ketodihydrosphingosine reductase, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDSRQ06136 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KDSRQ06136 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KDSRQ06136 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KDSRQ06136 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KDSRQ06136 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KDSRQ06136 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KDSRQ06136 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KDSRQ06136 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KDSRQ06136 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
KDSRQ06136 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
KDSRQ06136 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
KDSRQ06136 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KDSRQ06136 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KDSRQ06136 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KDSRQ06136 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KDSRQ06136 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KDSRQ06136 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KDSRQ06136 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
KDSRQ06136 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
KDSRQ06136 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KDSRQ06136 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KDSRQ06136 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KDSRQ06136 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
KDSRQ06136 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KDSRQ06136 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KDSRQ06136 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KDSRQ06136 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KDSRQ06136 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KDSRQ06136 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KDSRQ06136 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KDSRQ06136 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDSRQ06136 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
KDSRQ06136 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDSRQ06136 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDSRQ06136 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
KDSRQ06136 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KDSRQ06136 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28■■■□□ 2.07
KDSRQ06136 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
KDSRQ06136 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KDSRQ06136 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KDSRQ06136 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KDSRQ06136 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KDSRQ06136 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KDSRQ06136 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KDSRQ06136 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KDSRQ06136 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KDSRQ06136 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KDSRQ06136 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KDSRQ06136 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
KDSRQ06136 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
KDSRQ06136 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
KDSRQ06136 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KDSRQ06136 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KDSRQ06136 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KDSRQ06136 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KDSRQ06136 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KDSRQ06136 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KDSRQ06136 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
KDSRQ06136 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KDSRQ06136 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KDSRQ06136 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KDSRQ06136 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KDSRQ06136 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDSRQ06136 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KDSRQ06136 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KDSRQ06136 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KDSRQ06136 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KDSRQ06136 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KDSRQ06136 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KDSRQ06136 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KDSRQ06136 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KDSRQ06136 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KDSRQ06136 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KDSRQ06136 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KDSRQ06136 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KDSRQ06136 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
KDSRQ06136 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KDSRQ06136 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KDSRQ06136 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KDSRQ06136 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KDSRQ06136 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KDSRQ06136 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KDSRQ06136 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KDSRQ06136 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KDSRQ06136 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KDSRQ06136 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KDSRQ06136 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KDSRQ06136 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KDSRQ06136 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
KDSRQ06136 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
KDSRQ06136 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
KDSRQ06136 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KDSRQ06136 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KDSRQ06136 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
KDSRQ06136 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KDSRQ06136 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KDSRQ06136 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KDSRQ06136 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KDSRQ06136 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDSRQ06136 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms