Protein–RNA interactions for Protein: Q05C16

LRRC63, Leucine-rich repeat-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC63Q05C16 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
LRRC63Q05C16 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
LRRC63Q05C16 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
LRRC63Q05C16 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
LRRC63Q05C16 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
LRRC63Q05C16 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
LRRC63Q05C16 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
LRRC63Q05C16 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
LRRC63Q05C16 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
LRRC63Q05C16 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
LRRC63Q05C16 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
LRRC63Q05C16 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
LRRC63Q05C16 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
LRRC63Q05C16 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
LRRC63Q05C16 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
LRRC63Q05C16 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
LRRC63Q05C16 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
LRRC63Q05C16 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
LRRC63Q05C16 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
LRRC63Q05C16 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
LRRC63Q05C16 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
LRRC63Q05C16 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
LRRC63Q05C16 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
LRRC63Q05C16 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
LRRC63Q05C16 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
LRRC63Q05C16 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
LRRC63Q05C16 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
LRRC63Q05C16 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
LRRC63Q05C16 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
LRRC63Q05C16 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
LRRC63Q05C16 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
LRRC63Q05C16 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
LRRC63Q05C16 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LRRC63Q05C16 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
LRRC63Q05C16 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LRRC63Q05C16 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
LRRC63Q05C16 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
LRRC63Q05C16 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
LRRC63Q05C16 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
LRRC63Q05C16 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
LRRC63Q05C16 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
LRRC63Q05C16 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
LRRC63Q05C16 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LRRC63Q05C16 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LRRC63Q05C16 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
LRRC63Q05C16 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LRRC63Q05C16 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LRRC63Q05C16 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
LRRC63Q05C16 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LRRC63Q05C16 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LRRC63Q05C16 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LRRC63Q05C16 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
LRRC63Q05C16 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
LRRC63Q05C16 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
LRRC63Q05C16 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
LRRC63Q05C16 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
LRRC63Q05C16 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LRRC63Q05C16 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LRRC63Q05C16 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LRRC63Q05C16 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LRRC63Q05C16 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
LRRC63Q05C16 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
LRRC63Q05C16 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LRRC63Q05C16 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
LRRC63Q05C16 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LRRC63Q05C16 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LRRC63Q05C16 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LRRC63Q05C16 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LRRC63Q05C16 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
LRRC63Q05C16 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LRRC63Q05C16 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
LRRC63Q05C16 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
LRRC63Q05C16 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
LRRC63Q05C16 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LRRC63Q05C16 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LRRC63Q05C16 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
LRRC63Q05C16 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
LRRC63Q05C16 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
LRRC63Q05C16 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
LRRC63Q05C16 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LRRC63Q05C16 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LRRC63Q05C16 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LRRC63Q05C16 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
LRRC63Q05C16 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
LRRC63Q05C16 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
LRRC63Q05C16 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LRRC63Q05C16 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
LRRC63Q05C16 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
LRRC63Q05C16 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LRRC63Q05C16 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LRRC63Q05C16 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
LRRC63Q05C16 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
LRRC63Q05C16 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
LRRC63Q05C16 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LRRC63Q05C16 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LRRC63Q05C16 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LRRC63Q05C16 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
LRRC63Q05C16 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
LRRC63Q05C16 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LRRC63Q05C16 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms