Protein–RNA interactions for Protein: Q05823

RNASEL, 2-5A-dependent ribonuclease, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNASELQ05823 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
RNASELQ05823 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RNASELQ05823 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RNASELQ05823 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RNASELQ05823 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RNASELQ05823 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RNASELQ05823 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RNASELQ05823 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RNASELQ05823 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RNASELQ05823 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RNASELQ05823 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RNASELQ05823 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RNASELQ05823 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RNASELQ05823 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RNASELQ05823 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RNASELQ05823 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RNASELQ05823 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
RNASELQ05823 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RNASELQ05823 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RNASELQ05823 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RNASELQ05823 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RNASELQ05823 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RNASELQ05823 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RNASELQ05823 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RNASELQ05823 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RNASELQ05823 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RNASELQ05823 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RNASELQ05823 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RNASELQ05823 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RNASELQ05823 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
RNASELQ05823 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RNASELQ05823 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RNASELQ05823 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RNASELQ05823 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RNASELQ05823 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RNASELQ05823 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RNASELQ05823 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RNASELQ05823 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RNASELQ05823 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RNASELQ05823 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RNASELQ05823 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RNASELQ05823 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RNASELQ05823 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RNASELQ05823 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RNASELQ05823 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RNASELQ05823 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RNASELQ05823 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RNASELQ05823 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RNASELQ05823 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RNASELQ05823 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RNASELQ05823 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RNASELQ05823 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
RNASELQ05823 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RNASELQ05823 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RNASELQ05823 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RNASELQ05823 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RNASELQ05823 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RNASELQ05823 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RNASELQ05823 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RNASELQ05823 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RNASELQ05823 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RNASELQ05823 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RNASELQ05823 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RNASELQ05823 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RNASELQ05823 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RNASELQ05823 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RNASELQ05823 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RNASELQ05823 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RNASELQ05823 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RNASELQ05823 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RNASELQ05823 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RNASELQ05823 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RNASELQ05823 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RNASELQ05823 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RNASELQ05823 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RNASELQ05823 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RNASELQ05823 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RNASELQ05823 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RNASELQ05823 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RNASELQ05823 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RNASELQ05823 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RNASELQ05823 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RNASELQ05823 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RNASELQ05823 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RNASELQ05823 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RNASELQ05823 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
RNASELQ05823 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RNASELQ05823 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RNASELQ05823 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RNASELQ05823 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RNASELQ05823 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RNASELQ05823 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RNASELQ05823 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RNASELQ05823 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RNASELQ05823 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RNASELQ05823 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RNASELQ05823 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RNASELQ05823 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RNASELQ05823 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RNASELQ05823 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms