Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
GRIN1Q05586 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
GRIN1Q05586 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
GRIN1Q05586 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
GRIN1Q05586 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
GRIN1Q05586 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
GRIN1Q05586 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
GRIN1Q05586 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
GRIN1Q05586 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
GRIN1Q05586 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
GRIN1Q05586 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
GRIN1Q05586 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
GRIN1Q05586 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.77■■■□□ 2.52
GRIN1Q05586 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
GRIN1Q05586 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
GRIN1Q05586 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
GRIN1Q05586 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
GRIN1Q05586 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
GRIN1Q05586 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
GRIN1Q05586 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
GRIN1Q05586 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
GRIN1Q05586 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
GRIN1Q05586 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
GRIN1Q05586 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
GRIN1Q05586 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
GRIN1Q05586 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
GRIN1Q05586 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
GRIN1Q05586 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
GRIN1Q05586 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
GRIN1Q05586 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
GRIN1Q05586 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
GRIN1Q05586 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
GRIN1Q05586 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
GRIN1Q05586 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
GRIN1Q05586 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
GRIN1Q05586 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
GRIN1Q05586 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
GRIN1Q05586 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
GRIN1Q05586 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
GRIN1Q05586 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
GRIN1Q05586 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
GRIN1Q05586 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
GRIN1Q05586 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
GRIN1Q05586 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
GRIN1Q05586 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
GRIN1Q05586 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
GRIN1Q05586 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
GRIN1Q05586 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
GRIN1Q05586 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
GRIN1Q05586 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
GRIN1Q05586 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
GRIN1Q05586 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC30.51■■■□□ 2.47
GRIN1Q05586 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
GRIN1Q05586 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
GRIN1Q05586 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
GRIN1Q05586 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
GRIN1Q05586 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
GRIN1Q05586 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
GRIN1Q05586 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
GRIN1Q05586 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
GRIN1Q05586 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
GRIN1Q05586 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
GRIN1Q05586 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
GRIN1Q05586 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
GRIN1Q05586 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
GRIN1Q05586 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
GRIN1Q05586 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
GRIN1Q05586 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
GRIN1Q05586 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
GRIN1Q05586 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
GRIN1Q05586 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
GRIN1Q05586 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
GRIN1Q05586 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
GRIN1Q05586 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
GRIN1Q05586 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC30.4■■■□□ 2.46
GRIN1Q05586 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
GRIN1Q05586 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
GRIN1Q05586 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
GRIN1Q05586 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
GRIN1Q05586 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
GRIN1Q05586 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
GRIN1Q05586 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
GRIN1Q05586 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
GRIN1Q05586 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
GRIN1Q05586 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
GRIN1Q05586 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
GRIN1Q05586 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
GRIN1Q05586 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
GRIN1Q05586 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
GRIN1Q05586 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
GRIN1Q05586 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
GRIN1Q05586 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
GRIN1Q05586 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
GRIN1Q05586 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
GRIN1Q05586 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
GRIN1Q05586 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
GRIN1Q05586 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
GRIN1Q05586 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
GRIN1Q05586 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
GRIN1Q05586 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms