Protein–RNA interactions for Protein: Q04695

KRT17, Keratin, type I cytoskeletal 17, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT17Q04695 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
KRT17Q04695 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
KRT17Q04695 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
KRT17Q04695 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
KRT17Q04695 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
KRT17Q04695 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
KRT17Q04695 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
KRT17Q04695 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
KRT17Q04695 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
KRT17Q04695 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
KRT17Q04695 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
KRT17Q04695 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
KRT17Q04695 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
KRT17Q04695 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
KRT17Q04695 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
KRT17Q04695 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
KRT17Q04695 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
KRT17Q04695 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
KRT17Q04695 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
KRT17Q04695 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
KRT17Q04695 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
KRT17Q04695 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
KRT17Q04695 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
KRT17Q04695 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
KRT17Q04695 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
KRT17Q04695 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
KRT17Q04695 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
KRT17Q04695 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
KRT17Q04695 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
KRT17Q04695 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
KRT17Q04695 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
KRT17Q04695 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
KRT17Q04695 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
KRT17Q04695 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
KRT17Q04695 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
KRT17Q04695 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
KRT17Q04695 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
KRT17Q04695 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
KRT17Q04695 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
KRT17Q04695 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
KRT17Q04695 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
KRT17Q04695 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
KRT17Q04695 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
KRT17Q04695 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
KRT17Q04695 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
KRT17Q04695 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
KRT17Q04695 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
KRT17Q04695 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
KRT17Q04695 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
KRT17Q04695 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
KRT17Q04695 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
KRT17Q04695 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
KRT17Q04695 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
KRT17Q04695 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
KRT17Q04695 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
KRT17Q04695 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
KRT17Q04695 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
KRT17Q04695 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
KRT17Q04695 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
KRT17Q04695 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
KRT17Q04695 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
KRT17Q04695 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
KRT17Q04695 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
KRT17Q04695 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
KRT17Q04695 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
KRT17Q04695 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
KRT17Q04695 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
KRT17Q04695 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
KRT17Q04695 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
KRT17Q04695 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
KRT17Q04695 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
KRT17Q04695 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
KRT17Q04695 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
KRT17Q04695 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
KRT17Q04695 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
KRT17Q04695 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
KRT17Q04695 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
KRT17Q04695 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
KRT17Q04695 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
KRT17Q04695 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
KRT17Q04695 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
KRT17Q04695 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
KRT17Q04695 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
KRT17Q04695 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
KRT17Q04695 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
KRT17Q04695 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
KRT17Q04695 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
KRT17Q04695 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
KRT17Q04695 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
KRT17Q04695 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
KRT17Q04695 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
KRT17Q04695 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
KRT17Q04695 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
KRT17Q04695 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
KRT17Q04695 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
KRT17Q04695 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
KRT17Q04695 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
KRT17Q04695 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
KRT17Q04695 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
KRT17Q04695 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms