Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CAV1Q03135 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CAV1Q03135 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CAV1Q03135 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CAV1Q03135 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CAV1Q03135 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CAV1Q03135 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CAV1Q03135 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CAV1Q03135 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CAV1Q03135 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CAV1Q03135 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CAV1Q03135 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CAV1Q03135 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CAV1Q03135 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CAV1Q03135 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CAV1Q03135 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CAV1Q03135 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CAV1Q03135 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CAV1Q03135 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CAV1Q03135 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CAV1Q03135 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CAV1Q03135 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CAV1Q03135 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CAV1Q03135 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CAV1Q03135 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CAV1Q03135 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CAV1Q03135 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CAV1Q03135 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CAV1Q03135 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CAV1Q03135 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CAV1Q03135 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CAV1Q03135 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CAV1Q03135 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CAV1Q03135 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CAV1Q03135 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CAV1Q03135 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CAV1Q03135 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CAV1Q03135 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CAV1Q03135 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CAV1Q03135 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CAV1Q03135 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CAV1Q03135 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CAV1Q03135 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CAV1Q03135 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CAV1Q03135 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CAV1Q03135 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CAV1Q03135 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CAV1Q03135 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CAV1Q03135 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CAV1Q03135 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CAV1Q03135 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CAV1Q03135 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CAV1Q03135 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CAV1Q03135 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CAV1Q03135 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CAV1Q03135 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CAV1Q03135 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CAV1Q03135 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CAV1Q03135 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CAV1Q03135 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CAV1Q03135 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CAV1Q03135 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CAV1Q03135 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CAV1Q03135 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CAV1Q03135 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CAV1Q03135 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CAV1Q03135 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CAV1Q03135 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CAV1Q03135 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CAV1Q03135 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CAV1Q03135 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CAV1Q03135 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CAV1Q03135 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CAV1Q03135 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CAV1Q03135 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CAV1Q03135 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CAV1Q03135 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CAV1Q03135 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CAV1Q03135 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CAV1Q03135 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CAV1Q03135 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CAV1Q03135 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CAV1Q03135 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CAV1Q03135 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CAV1Q03135 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CAV1Q03135 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CAV1Q03135 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CAV1Q03135 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CAV1Q03135 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CAV1Q03135 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CAV1Q03135 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CAV1Q03135 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CAV1Q03135 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CAV1Q03135 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CAV1Q03135 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CAV1Q03135 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CAV1Q03135 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CAV1Q03135 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CAV1Q03135 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CAV1Q03135 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms