Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
CAV1Q03135 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CAV1Q03135 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CAV1Q03135 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CAV1Q03135 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CAV1Q03135 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
CAV1Q03135 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CAV1Q03135 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CAV1Q03135 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CAV1Q03135 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CAV1Q03135 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CAV1Q03135 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
CAV1Q03135 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CAV1Q03135 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CAV1Q03135 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
CAV1Q03135 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CAV1Q03135 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CAV1Q03135 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CAV1Q03135 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CAV1Q03135 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CAV1Q03135 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CAV1Q03135 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CAV1Q03135 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
CAV1Q03135 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CAV1Q03135 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CAV1Q03135 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
CAV1Q03135 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
CAV1Q03135 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
CAV1Q03135 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
CAV1Q03135 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
CAV1Q03135 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
CAV1Q03135 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
CAV1Q03135 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
CAV1Q03135 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
CAV1Q03135 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CAV1Q03135 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CAV1Q03135 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CAV1Q03135 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CAV1Q03135 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CAV1Q03135 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CAV1Q03135 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
CAV1Q03135 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CAV1Q03135 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CAV1Q03135 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CAV1Q03135 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CAV1Q03135 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CAV1Q03135 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
CAV1Q03135 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CAV1Q03135 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CAV1Q03135 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CAV1Q03135 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CAV1Q03135 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
CAV1Q03135 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CAV1Q03135 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CAV1Q03135 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CAV1Q03135 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CAV1Q03135 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CAV1Q03135 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CAV1Q03135 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CAV1Q03135 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CAV1Q03135 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CAV1Q03135 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CAV1Q03135 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CAV1Q03135 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CAV1Q03135 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CAV1Q03135 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CAV1Q03135 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CAV1Q03135 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CAV1Q03135 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CAV1Q03135 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CAV1Q03135 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CAV1Q03135 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CAV1Q03135 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CAV1Q03135 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CAV1Q03135 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CAV1Q03135 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CAV1Q03135 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CAV1Q03135 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CAV1Q03135 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CAV1Q03135 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CAV1Q03135 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CAV1Q03135 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CAV1Q03135 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CAV1Q03135 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CAV1Q03135 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CAV1Q03135 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CAV1Q03135 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CAV1Q03135 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
CAV1Q03135 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CAV1Q03135 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CAV1Q03135 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CAV1Q03135 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CAV1Q03135 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CAV1Q03135 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CAV1Q03135 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CAV1Q03135 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CAV1Q03135 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CAV1Q03135 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CAV1Q03135 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CAV1Q03135 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms