Protein–RNA interactions for Protein: Q02790

FKBP4, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FKBP4Q02790 ABHD17A-203ENST00000588598 5425 ntTSL 223.28■■□□□ 1.324e-6■■■■■ 31.1
FKBP4Q02790 ZC3H3-202ENST00000528401 546 ntTSL 323.17■■□□□ 1.34e-6■■■■■ 31.1
FKBP4Q02790 LAMA5-208ENST00000474128 579 ntTSL 322.89■■□□□ 1.254e-7■■■■■ 31.1
FKBP4Q02790 SBF1-203ENST00000399627 811 ntTSL 522.79■■□□□ 1.244e-6■■■■■ 31.1
FKBP4Q02790 TCF20-204ENST00000515426 633 ntTSL 522.4■■□□□ 1.184e-6■■■■■ 31.1
FKBP4Q02790 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.054e-6■■■■■ 31.1
FKBP4Q02790 ABHD17A-205ENST00000591351 4647 ntTSL 221.18■□□□□ 0.984e-6■■■■■ 31.1
FKBP4Q02790 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.924e-6■■■■■ 31.1
FKBP4Q02790 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.894e-6■■■■■ 31.1
FKBP4Q02790 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.884e-6■■■■■ 31.1
FKBP4Q02790 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.874e-6■■■■■ 31.1
FKBP4Q02790 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.864e-6■■■■■ 31.1
FKBP4Q02790 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.754e-6■■■■■ 31.1
FKBP4Q02790 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.714e-6■■■■■ 31.1
FKBP4Q02790 NR5A1-203ENST00000455734 826 ntTSL 318.62■□□□□ 0.574e-6■■■■■ 31.1
FKBP4Q02790 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.484e-6■■■■■ 31.1
FKBP4Q02790 TBCEL-201ENST00000284259 3923 ntTSL 1 (best)17.6■□□□□ 0.414e-6■■■■■ 31.1
FKBP4Q02790 NINJ1-202ENST00000461162 861 ntTSL 217.34■□□□□ 0.374e-6■■■■■ 31.1
FKBP4Q02790 RAI1-203ENST00000471135 570 ntTSL 316.87■□□□□ 0.294e-6■■■■■ 31.1
FKBP4Q02790 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.264e-6■■■■■ 31.1
FKBP4Q02790 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.264e-6■■■■■ 31.1
FKBP4Q02790 AATK-206ENST00000572798 407 ntTSL 216.44■□□□□ 0.224e-6■■■■■ 31.1
FKBP4Q02790 BCOR-207ENST00000412952 288 ntTSL 516.38■□□□□ 0.214e-6■■■■■ 31.1
FKBP4Q02790 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.214e-6■■■■■ 31.1
FKBP4Q02790 NINJ1-203ENST00000470314 834 ntTSL 316.29■□□□□ 0.24e-6■■■■■ 31.1
FKBP4Q02790 ANP32B-201ENST00000339399 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.184e-6■■■■■ 31.1
FKBP4Q02790 REV3L-205ENST00000422377 10964 ntTSL 215.86■□□□□ 0.134e-6■■■■■ 31.1
FKBP4Q02790 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.014e-6■■■■■ 31.1
FKBP4Q02790 E2F3-203ENST00000613242 4094 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.154e-6■■■■■ 31.1
FKBP4Q02790 REV3L-201ENST00000358835 10815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.194e-6■■■■■ 31.1
FKBP4Q02790 TBCEL-202ENST00000422003 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.234e-6■■■■■ 31.1
FKBP4Q02790 NINJ1-205ENST00000490564 488 ntTSL 1 (best)13.45□□□□□ -0.264e-6■■■■■ 31.1
FKBP4Q02790 BCOR-201ENST00000342274 6390 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.464e-6■■■■■ 31.1
FKBP4Q02790 REV3L-202ENST00000368802 10701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.534e-6■■■■■ 31.1
FKBP4Q02790 BCOR-206ENST00000406200 4216 ntTSL 211.47□□□□□ -0.574e-6■■■■■ 31.1
FKBP4Q02790 BCOR-203ENST00000378455 6338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.74e-6■■■■■ 31.1
FKBP4Q02790 LINC02533-201ENST00000563079 2272 ntTSL 4 BASIC10.27□□□□□ -0.764e-6■■■■■ 31.1
FKBP4Q02790 REV3L-203ENST00000368805 10461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.994e-6■■■■■ 31.1
FKBP4Q02790 REV3L-206ENST00000434009 10644 ntTSL 23.01□□□□□ -1.934e-6■■■■■ 31.1
FKBP4Q02790 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.518e-7■■■■■ 31.1
FKBP4Q02790 MEGF6-205ENST00000485002 4705 ntTSL 518.37■□□□□ 0.538e-7■■■■■ 31.1
FKBP4Q02790 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.451e-10■■■■■ 31
FKBP4Q02790 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.491e-10■■■■■ 31
FKBP4Q02790 SLC16A3-213ENST00000582715 279 ntTSL 520.31■□□□□ 0.841e-10■■■■■ 31
FKBP4Q02790 MNT-206ENST00000574559 580 ntTSL 424.77■■□□□ 1.562e-6■■■■■ 30.6
FKBP4Q02790 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.042e-6■■■■■ 30.6
FKBP4Q02790 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.12e-6■■■■■ 30.6
FKBP4Q02790 ATP11A-201ENST00000375630 8768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.081e-6■■■■■ 30.6
FKBP4Q02790 ATP11A-202ENST00000375645 8795 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.11e-6■■■■■ 30.6
FKBP4Q02790 ATP11A-212ENST00000487903 8858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.471e-6■■■■■ 30.6
FKBP4Q02790 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.31e-6■■■■■ 30.2
FKBP4Q02790 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.713e-6■■■■■ 30.1
FKBP4Q02790 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC25.1■■□□□ 1.613e-6■■■■■ 30.1
FKBP4Q02790 AL390719.1-203ENST00000456409 750 ntTSL 215.05■□□□□ -03e-6■■■■■ 30.1
FKBP4Q02790 AL390719.1-202ENST00000394517 397 ntTSL 512.76□□□□□ -0.373e-6■■■■■ 30.1
FKBP4Q02790 SLC16A3-209ENST00000580098 859 ntTSL 225.18■■□□□ 1.624e-11■■■■■ 30
FKBP4Q02790 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC6.92□□□□□ -1.35e-7■■■■■ 29.9
FKBP4Q02790 RXRA-201ENST00000356384 5770 ntTSL 518.92■□□□□ 0.622e-6■■■■■ 29.8
FKBP4Q02790 TSPAN4-217ENST00000527644 968 ntTSL 233.81■■■■□ 33e-6■■■■■ 29.8
FKBP4Q02790 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.893e-6■■■■■ 29.8
FKBP4Q02790 ZC3H3-201ENST00000262577 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.223e-6■■■■■ 29.8
FKBP4Q02790 PLXNB2-205ENST00000432455 1620 ntTSL 522.1■■□□□ 1.131e-6■■■■■ 29.7
FKBP4Q02790 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.023e-6■■■■■ 29.7
FKBP4Q02790 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.613e-6■■■■■ 29.7
FKBP4Q02790 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.066e-7■■■■■ 29.5
FKBP4Q02790 SLC22A18-213ENST00000498244 325 ntTSL 229.81■■■□□ 2.361e-6■■■■■ 29.3
FKBP4Q02790 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.361e-6■■■■■ 29.3
FKBP4Q02790 PIP4K2B-202ENST00000617499 547 ntTSL 423.61■■□□□ 1.371e-6■■■■■ 29.3
FKBP4Q02790 MTHFD1L-207ENST00000441122 1134 ntTSL 523.31■■□□□ 1.321e-6■■■■■ 29.3
FKBP4Q02790 BAIAP2-210ENST00000572498 858 ntTSL 220.15■□□□□ 0.821e-6■■■■■ 29.3
FKBP4Q02790 MTHFD1L-212ENST00000618312 3159 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.851e-6■■■■■ 29.3
FKBP4Q02790 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.873e-6■■■■■ 29.2
FKBP4Q02790 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.673e-6■■■■■ 29.2
FKBP4Q02790 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.593e-6■■■■■ 29.2
FKBP4Q02790 EIF5A-210ENST00000575001 609 ntTSL 230.82■■■□□ 2.523e-6■■■■■ 29.2
FKBP4Q02790 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.983e-6■■■■■ 29.2
FKBP4Q02790 EIF5A-207ENST00000572815 811 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.153e-6■■■■■ 29.2
FKBP4Q02790 EIF5A-203ENST00000355068 923 ntTSL 28.4□□□□□ -1.063e-6■■■■■ 29.2
FKBP4Q02790 MKNK2-210ENST00000589534 454 ntTSL 234.32■■■■□ 3.081e-6■■■■■ 29
FKBP4Q02790 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.661e-6■■■■■ 29
FKBP4Q02790 MKNK2-205ENST00000586828 1503 ntTSL 224.4■■□□□ 1.51e-6■■■■■ 29
FKBP4Q02790 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.511e-6■■■■■ 29
FKBP4Q02790 MKNK2-209ENST00000589509 352 ntTSL 514.84□□□□□ -0.031e-6■■■■■ 29
FKBP4Q02790 MKNK2-213ENST00000591601 3582 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.21e-6■■■■■ 29
FKBP4Q02790 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.499e-7■■■■■ 28.9
FKBP4Q02790 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.489e-7■■■■■ 28.9
FKBP4Q02790 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.459e-7■■■■■ 28.9
FKBP4Q02790 NECAB3-222ENST00000607805 969 ntTSL 527.95■■■□□ 2.061e-6■■■■■ 28.9
FKBP4Q02790 NECAB3-211ENST00000485399 1373 ntTSL 226.53■■□□□ 1.841e-6■■■■■ 28.9
FKBP4Q02790 NECAB3-215ENST00000494174 859 ntTSL 525.18■■□□□ 1.621e-6■■■■■ 28.9
FKBP4Q02790 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.551e-6■■■■■ 28.9
FKBP4Q02790 NECAB3-220ENST00000606699 1022 ntTSL 224.68■■□□□ 1.541e-6■■■■■ 28.9
FKBP4Q02790 NECAB3-213ENST00000488489 2142 ntTSL 224.38■■□□□ 1.491e-6■■■■■ 28.9
FKBP4Q02790 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.311e-6■■■■■ 28.9
FKBP4Q02790 NECAB3-214ENST00000493590 625 ntTSL 522.61■■□□□ 1.211e-6■■■■■ 28.9
FKBP4Q02790 NECAB3-219ENST00000606690 900 ntTSL 518.88■□□□□ 0.611e-6■■■■■ 28.9
FKBP4Q02790 NECAB3-203ENST00000439478 925 ntTSL 518.88■□□□□ 0.611e-6■■■■■ 28.9
FKBP4Q02790 VPS9D1-203ENST00000563798 459 ntTSL 322.55■■□□□ 1.24e-8■■■■■ 28.9
FKBP4Q02790 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.214e-8■■■■■ 28.9
FKBP4Q02790 PHF10-206ENST00000621772 1651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.242e-7■■■■■ 28.9
Retrieved 100 of 2,944 protein–RNA pairs in 165 ms