Protein–RNA interactions for Protein: Q01973

ROR1, Inactive tyrosine-protein kinase transmembrane receptor ROR1, humanhuman

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROR1Q01973 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ROR1Q01973 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ROR1Q01973 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
ROR1Q01973 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
ROR1Q01973 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ROR1Q01973 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ROR1Q01973 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ROR1Q01973 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
ROR1Q01973 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ROR1Q01973 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ROR1Q01973 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ROR1Q01973 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ROR1Q01973 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ROR1Q01973 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ROR1Q01973 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
ROR1Q01973 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ROR1Q01973 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ROR1Q01973 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ROR1Q01973 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ROR1Q01973 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ROR1Q01973 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ROR1Q01973 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ROR1Q01973 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ROR1Q01973 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ROR1Q01973 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ROR1Q01973 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ROR1Q01973 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ROR1Q01973 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
ROR1Q01973 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
ROR1Q01973 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ROR1Q01973 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ROR1Q01973 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ROR1Q01973 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ROR1Q01973 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ROR1Q01973 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ROR1Q01973 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ROR1Q01973 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ROR1Q01973 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ROR1Q01973 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ROR1Q01973 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ROR1Q01973 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ROR1Q01973 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ROR1Q01973 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ROR1Q01973 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ROR1Q01973 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
ROR1Q01973 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ROR1Q01973 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ROR1Q01973 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ROR1Q01973 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ROR1Q01973 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ROR1Q01973 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ROR1Q01973 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ROR1Q01973 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ROR1Q01973 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ROR1Q01973 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ROR1Q01973 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ROR1Q01973 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ROR1Q01973 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
ROR1Q01973 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ROR1Q01973 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ROR1Q01973 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ROR1Q01973 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ROR1Q01973 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ROR1Q01973 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ROR1Q01973 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ROR1Q01973 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ROR1Q01973 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
ROR1Q01973 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ROR1Q01973 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ROR1Q01973 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ROR1Q01973 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ROR1Q01973 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ROR1Q01973 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ROR1Q01973 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ROR1Q01973 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ROR1Q01973 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
ROR1Q01973 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ROR1Q01973 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ROR1Q01973 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ROR1Q01973 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ROR1Q01973 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ROR1Q01973 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ROR1Q01973 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ROR1Q01973 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ROR1Q01973 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ROR1Q01973 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ROR1Q01973 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ROR1Q01973 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ROR1Q01973 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ROR1Q01973 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ROR1Q01973 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ROR1Q01973 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ROR1Q01973 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ROR1Q01973 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ROR1Q01973 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ROR1Q01973 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ROR1Q01973 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ROR1Q01973 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ROR1Q01973 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ROR1Q01973 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms