Protein–RNA interactions for Protein: Q00973

B4GALNT1, Beta-1,4 N-acetylgalactosaminyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4GALNT1Q00973 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
B4GALNT1Q00973 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
B4GALNT1Q00973 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
B4GALNT1Q00973 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
B4GALNT1Q00973 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
B4GALNT1Q00973 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
B4GALNT1Q00973 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
B4GALNT1Q00973 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
B4GALNT1Q00973 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
B4GALNT1Q00973 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
B4GALNT1Q00973 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
B4GALNT1Q00973 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
B4GALNT1Q00973 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
B4GALNT1Q00973 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
B4GALNT1Q00973 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
B4GALNT1Q00973 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
B4GALNT1Q00973 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
B4GALNT1Q00973 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
B4GALNT1Q00973 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
B4GALNT1Q00973 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
B4GALNT1Q00973 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
B4GALNT1Q00973 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
B4GALNT1Q00973 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
B4GALNT1Q00973 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
B4GALNT1Q00973 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
B4GALNT1Q00973 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
B4GALNT1Q00973 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
B4GALNT1Q00973 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
B4GALNT1Q00973 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
B4GALNT1Q00973 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
B4GALNT1Q00973 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
B4GALNT1Q00973 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
B4GALNT1Q00973 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
B4GALNT1Q00973 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
B4GALNT1Q00973 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
B4GALNT1Q00973 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
B4GALNT1Q00973 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
B4GALNT1Q00973 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
B4GALNT1Q00973 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
B4GALNT1Q00973 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
B4GALNT1Q00973 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
B4GALNT1Q00973 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
B4GALNT1Q00973 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
B4GALNT1Q00973 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
B4GALNT1Q00973 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
B4GALNT1Q00973 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
B4GALNT1Q00973 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
B4GALNT1Q00973 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
B4GALNT1Q00973 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
B4GALNT1Q00973 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
B4GALNT1Q00973 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
B4GALNT1Q00973 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
B4GALNT1Q00973 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
B4GALNT1Q00973 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
B4GALNT1Q00973 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
B4GALNT1Q00973 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
B4GALNT1Q00973 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
B4GALNT1Q00973 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
B4GALNT1Q00973 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
B4GALNT1Q00973 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
B4GALNT1Q00973 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
B4GALNT1Q00973 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
B4GALNT1Q00973 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
B4GALNT1Q00973 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
B4GALNT1Q00973 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
B4GALNT1Q00973 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
B4GALNT1Q00973 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
B4GALNT1Q00973 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
B4GALNT1Q00973 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
B4GALNT1Q00973 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
B4GALNT1Q00973 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
B4GALNT1Q00973 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
B4GALNT1Q00973 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
B4GALNT1Q00973 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
B4GALNT1Q00973 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
B4GALNT1Q00973 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
B4GALNT1Q00973 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
B4GALNT1Q00973 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
B4GALNT1Q00973 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
B4GALNT1Q00973 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
B4GALNT1Q00973 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
B4GALNT1Q00973 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
B4GALNT1Q00973 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
B4GALNT1Q00973 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
B4GALNT1Q00973 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
B4GALNT1Q00973 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
B4GALNT1Q00973 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
B4GALNT1Q00973 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
B4GALNT1Q00973 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
B4GALNT1Q00973 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
B4GALNT1Q00973 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
B4GALNT1Q00973 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
B4GALNT1Q00973 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
B4GALNT1Q00973 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
B4GALNT1Q00973 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
B4GALNT1Q00973 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
B4GALNT1Q00973 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
B4GALNT1Q00973 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
B4GALNT1Q00973 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
B4GALNT1Q00973 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms