Protein–RNA interactions for Protein: P82673

MRPS35, 28S ribosomal protein S35, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS35P82673 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MRPS35P82673 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MRPS35P82673 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MRPS35P82673 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MRPS35P82673 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MRPS35P82673 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MRPS35P82673 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MRPS35P82673 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MRPS35P82673 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MRPS35P82673 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MRPS35P82673 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MRPS35P82673 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MRPS35P82673 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MRPS35P82673 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MRPS35P82673 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MRPS35P82673 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MRPS35P82673 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MRPS35P82673 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MRPS35P82673 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MRPS35P82673 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MRPS35P82673 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MRPS35P82673 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MRPS35P82673 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
MRPS35P82673 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MRPS35P82673 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MRPS35P82673 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MRPS35P82673 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MRPS35P82673 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MRPS35P82673 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MRPS35P82673 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MRPS35P82673 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
MRPS35P82673 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MRPS35P82673 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MRPS35P82673 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MRPS35P82673 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MRPS35P82673 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MRPS35P82673 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MRPS35P82673 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MRPS35P82673 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MRPS35P82673 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MRPS35P82673 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MRPS35P82673 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MRPS35P82673 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MRPS35P82673 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MRPS35P82673 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MRPS35P82673 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MRPS35P82673 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MRPS35P82673 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MRPS35P82673 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MRPS35P82673 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MRPS35P82673 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MRPS35P82673 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MRPS35P82673 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
MRPS35P82673 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MRPS35P82673 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MRPS35P82673 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MRPS35P82673 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MRPS35P82673 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MRPS35P82673 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MRPS35P82673 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MRPS35P82673 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MRPS35P82673 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MRPS35P82673 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MRPS35P82673 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MRPS35P82673 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MRPS35P82673 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MRPS35P82673 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MRPS35P82673 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MRPS35P82673 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MRPS35P82673 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MRPS35P82673 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MRPS35P82673 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MRPS35P82673 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MRPS35P82673 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MRPS35P82673 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MRPS35P82673 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MRPS35P82673 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MRPS35P82673 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MRPS35P82673 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MRPS35P82673 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MRPS35P82673 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MRPS35P82673 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MRPS35P82673 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MRPS35P82673 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MRPS35P82673 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
MRPS35P82673 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
MRPS35P82673 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MRPS35P82673 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MRPS35P82673 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MRPS35P82673 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MRPS35P82673 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MRPS35P82673 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MRPS35P82673 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MRPS35P82673 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MRPS35P82673 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MRPS35P82673 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MRPS35P82673 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MRPS35P82673 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MRPS35P82673 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MRPS35P82673 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms