Protein–RNA interactions for Protein: P80075

CCL8, C-C motif chemokine 8, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL8P80075 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCL8P80075 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCL8P80075 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCL8P80075 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCL8P80075 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCL8P80075 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCL8P80075 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCL8P80075 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCL8P80075 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCL8P80075 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCL8P80075 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCL8P80075 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCL8P80075 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCL8P80075 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCL8P80075 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCL8P80075 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCL8P80075 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCL8P80075 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCL8P80075 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCL8P80075 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CCL8P80075 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCL8P80075 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCL8P80075 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCL8P80075 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCL8P80075 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCL8P80075 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCL8P80075 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCL8P80075 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCL8P80075 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCL8P80075 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCL8P80075 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCL8P80075 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCL8P80075 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCL8P80075 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCL8P80075 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCL8P80075 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCL8P80075 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCL8P80075 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCL8P80075 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCL8P80075 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCL8P80075 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCL8P80075 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCL8P80075 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCL8P80075 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCL8P80075 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCL8P80075 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCL8P80075 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCL8P80075 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCL8P80075 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCL8P80075 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCL8P80075 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCL8P80075 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCL8P80075 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCL8P80075 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCL8P80075 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCL8P80075 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCL8P80075 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCL8P80075 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCL8P80075 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCL8P80075 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCL8P80075 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCL8P80075 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCL8P80075 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCL8P80075 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCL8P80075 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCL8P80075 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCL8P80075 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCL8P80075 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCL8P80075 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCL8P80075 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCL8P80075 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCL8P80075 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCL8P80075 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCL8P80075 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCL8P80075 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCL8P80075 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCL8P80075 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCL8P80075 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCL8P80075 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCL8P80075 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCL8P80075 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCL8P80075 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCL8P80075 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCL8P80075 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCL8P80075 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCL8P80075 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCL8P80075 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCL8P80075 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCL8P80075 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCL8P80075 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCL8P80075 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCL8P80075 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCL8P80075 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCL8P80075 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCL8P80075 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCL8P80075 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCL8P80075 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCL8P80075 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCL8P80075 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCL8P80075 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms