Protein–RNA interactions for Protein: P79483

HLA-DRB3, HLA class II histocompatibility antigen, DR beta 3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DRB3P79483 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HLA-DRB3P79483 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HLA-DRB3P79483 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HLA-DRB3P79483 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HLA-DRB3P79483 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HLA-DRB3P79483 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HLA-DRB3P79483 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HLA-DRB3P79483 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HLA-DRB3P79483 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HLA-DRB3P79483 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HLA-DRB3P79483 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HLA-DRB3P79483 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HLA-DRB3P79483 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HLA-DRB3P79483 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HLA-DRB3P79483 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HLA-DRB3P79483 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HLA-DRB3P79483 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HLA-DRB3P79483 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HLA-DRB3P79483 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HLA-DRB3P79483 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HLA-DRB3P79483 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HLA-DRB3P79483 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HLA-DRB3P79483 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HLA-DRB3P79483 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HLA-DRB3P79483 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HLA-DRB3P79483 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HLA-DRB3P79483 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HLA-DRB3P79483 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HLA-DRB3P79483 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HLA-DRB3P79483 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HLA-DRB3P79483 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HLA-DRB3P79483 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HLA-DRB3P79483 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HLA-DRB3P79483 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HLA-DRB3P79483 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-DRB3P79483 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-DRB3P79483 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-DRB3P79483 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-DRB3P79483 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-DRB3P79483 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-DRB3P79483 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-DRB3P79483 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-DRB3P79483 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-DRB3P79483 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-DRB3P79483 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-DRB3P79483 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-DRB3P79483 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-DRB3P79483 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-DRB3P79483 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-DRB3P79483 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-DRB3P79483 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HLA-DRB3P79483 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HLA-DRB3P79483 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HLA-DRB3P79483 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HLA-DRB3P79483 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-DRB3P79483 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-DRB3P79483 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-DRB3P79483 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HLA-DRB3P79483 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HLA-DRB3P79483 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-DRB3P79483 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-DRB3P79483 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-DRB3P79483 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-DRB3P79483 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HLA-DRB3P79483 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HLA-DRB3P79483 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-DRB3P79483 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-DRB3P79483 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-DRB3P79483 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-DRB3P79483 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-DRB3P79483 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HLA-DRB3P79483 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HLA-DRB3P79483 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HLA-DRB3P79483 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HLA-DRB3P79483 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HLA-DRB3P79483 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HLA-DRB3P79483 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HLA-DRB3P79483 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HLA-DRB3P79483 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-DRB3P79483 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-DRB3P79483 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HLA-DRB3P79483 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLA-DRB3P79483 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLA-DRB3P79483 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLA-DRB3P79483 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLA-DRB3P79483 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLA-DRB3P79483 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLA-DRB3P79483 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-DRB3P79483 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-DRB3P79483 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HLA-DRB3P79483 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HLA-DRB3P79483 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HLA-DRB3P79483 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HLA-DRB3P79483 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HLA-DRB3P79483 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HLA-DRB3P79483 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HLA-DRB3P79483 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HLA-DRB3P79483 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HLA-DRB3P79483 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HLA-DRB3P79483 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms