Protein–RNA interactions for Protein: P78324

SIRPA, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type substrate 1, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRPAP78324 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIRPAP78324 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SIRPAP78324 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIRPAP78324 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIRPAP78324 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIRPAP78324 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIRPAP78324 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIRPAP78324 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIRPAP78324 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIRPAP78324 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIRPAP78324 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIRPAP78324 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SIRPAP78324 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIRPAP78324 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIRPAP78324 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SIRPAP78324 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SIRPAP78324 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIRPAP78324 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIRPAP78324 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SIRPAP78324 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIRPAP78324 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIRPAP78324 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIRPAP78324 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIRPAP78324 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIRPAP78324 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIRPAP78324 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIRPAP78324 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIRPAP78324 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIRPAP78324 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIRPAP78324 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIRPAP78324 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIRPAP78324 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SIRPAP78324 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIRPAP78324 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIRPAP78324 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIRPAP78324 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIRPAP78324 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIRPAP78324 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIRPAP78324 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIRPAP78324 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SIRPAP78324 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIRPAP78324 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIRPAP78324 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIRPAP78324 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIRPAP78324 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIRPAP78324 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIRPAP78324 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIRPAP78324 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIRPAP78324 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIRPAP78324 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIRPAP78324 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIRPAP78324 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIRPAP78324 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SIRPAP78324 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIRPAP78324 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIRPAP78324 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIRPAP78324 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SIRPAP78324 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIRPAP78324 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIRPAP78324 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIRPAP78324 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIRPAP78324 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SIRPAP78324 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SIRPAP78324 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SIRPAP78324 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIRPAP78324 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIRPAP78324 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIRPAP78324 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIRPAP78324 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIRPAP78324 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIRPAP78324 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SIRPAP78324 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIRPAP78324 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIRPAP78324 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIRPAP78324 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIRPAP78324 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIRPAP78324 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SIRPAP78324 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIRPAP78324 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIRPAP78324 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIRPAP78324 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIRPAP78324 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIRPAP78324 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIRPAP78324 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIRPAP78324 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIRPAP78324 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIRPAP78324 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIRPAP78324 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIRPAP78324 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIRPAP78324 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIRPAP78324 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIRPAP78324 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIRPAP78324 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIRPAP78324 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIRPAP78324 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIRPAP78324 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SIRPAP78324 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
SIRPAP78324 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIRPAP78324 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SIRPAP78324 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms