Protein–RNA interactions for Protein: P68543

UBXN2A, UBX domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN2AP68543 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
UBXN2AP68543 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
UBXN2AP68543 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
UBXN2AP68543 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
UBXN2AP68543 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
UBXN2AP68543 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
UBXN2AP68543 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
UBXN2AP68543 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
UBXN2AP68543 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
UBXN2AP68543 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
UBXN2AP68543 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
UBXN2AP68543 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
UBXN2AP68543 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
UBXN2AP68543 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
UBXN2AP68543 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
UBXN2AP68543 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
UBXN2AP68543 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
UBXN2AP68543 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
UBXN2AP68543 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
UBXN2AP68543 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
UBXN2AP68543 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
UBXN2AP68543 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
UBXN2AP68543 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
UBXN2AP68543 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
UBXN2AP68543 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC31.59■■■□□ 2.65
UBXN2AP68543 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
UBXN2AP68543 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
UBXN2AP68543 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.56■■■□□ 2.64
UBXN2AP68543 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
UBXN2AP68543 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
UBXN2AP68543 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
UBXN2AP68543 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
UBXN2AP68543 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
UBXN2AP68543 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
UBXN2AP68543 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
UBXN2AP68543 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
UBXN2AP68543 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
UBXN2AP68543 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
UBXN2AP68543 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
UBXN2AP68543 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC31.48■■■□□ 2.63
UBXN2AP68543 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
UBXN2AP68543 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
UBXN2AP68543 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
UBXN2AP68543 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
UBXN2AP68543 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
UBXN2AP68543 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
UBXN2AP68543 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
UBXN2AP68543 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
UBXN2AP68543 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
UBXN2AP68543 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
UBXN2AP68543 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
UBXN2AP68543 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
UBXN2AP68543 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
UBXN2AP68543 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
UBXN2AP68543 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
UBXN2AP68543 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
UBXN2AP68543 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
UBXN2AP68543 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
UBXN2AP68543 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
UBXN2AP68543 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
UBXN2AP68543 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
UBXN2AP68543 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC31.37■■■□□ 2.61
UBXN2AP68543 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
UBXN2AP68543 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
UBXN2AP68543 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
UBXN2AP68543 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
UBXN2AP68543 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
UBXN2AP68543 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
UBXN2AP68543 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
UBXN2AP68543 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
UBXN2AP68543 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
UBXN2AP68543 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
UBXN2AP68543 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC31.28■■■□□ 2.6
UBXN2AP68543 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
UBXN2AP68543 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
UBXN2AP68543 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
UBXN2AP68543 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
UBXN2AP68543 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
UBXN2AP68543 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
UBXN2AP68543 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
UBXN2AP68543 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
UBXN2AP68543 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
UBXN2AP68543 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
UBXN2AP68543 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
UBXN2AP68543 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
UBXN2AP68543 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC31.17■■■□□ 2.58
UBXN2AP68543 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
UBXN2AP68543 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
UBXN2AP68543 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
UBXN2AP68543 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
UBXN2AP68543 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
UBXN2AP68543 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
UBXN2AP68543 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
UBXN2AP68543 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
UBXN2AP68543 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
UBXN2AP68543 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
UBXN2AP68543 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
UBXN2AP68543 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
UBXN2AP68543 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
UBXN2AP68543 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms