Protein–RNA interactions for Protein: P62873

GNB1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB1P62873 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GNB1P62873 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GNB1P62873 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GNB1P62873 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GNB1P62873 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GNB1P62873 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GNB1P62873 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GNB1P62873 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GNB1P62873 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GNB1P62873 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GNB1P62873 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GNB1P62873 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GNB1P62873 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GNB1P62873 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GNB1P62873 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GNB1P62873 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GNB1P62873 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GNB1P62873 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GNB1P62873 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GNB1P62873 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GNB1P62873 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GNB1P62873 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GNB1P62873 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GNB1P62873 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GNB1P62873 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GNB1P62873 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GNB1P62873 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GNB1P62873 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GNB1P62873 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GNB1P62873 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GNB1P62873 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GNB1P62873 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GNB1P62873 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GNB1P62873 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GNB1P62873 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GNB1P62873 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GNB1P62873 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GNB1P62873 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GNB1P62873 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GNB1P62873 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GNB1P62873 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GNB1P62873 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GNB1P62873 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GNB1P62873 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GNB1P62873 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GNB1P62873 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GNB1P62873 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GNB1P62873 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GNB1P62873 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GNB1P62873 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GNB1P62873 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GNB1P62873 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GNB1P62873 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GNB1P62873 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GNB1P62873 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GNB1P62873 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GNB1P62873 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GNB1P62873 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GNB1P62873 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GNB1P62873 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GNB1P62873 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GNB1P62873 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GNB1P62873 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GNB1P62873 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GNB1P62873 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GNB1P62873 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GNB1P62873 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GNB1P62873 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GNB1P62873 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GNB1P62873 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GNB1P62873 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GNB1P62873 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GNB1P62873 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GNB1P62873 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GNB1P62873 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GNB1P62873 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GNB1P62873 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GNB1P62873 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GNB1P62873 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GNB1P62873 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GNB1P62873 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GNB1P62873 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GNB1P62873 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GNB1P62873 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GNB1P62873 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GNB1P62873 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GNB1P62873 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GNB1P62873 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GNB1P62873 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GNB1P62873 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GNB1P62873 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GNB1P62873 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GNB1P62873 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GNB1P62873 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GNB1P62873 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GNB1P62873 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GNB1P62873 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GNB1P62873 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GNB1P62873 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GNB1P62873 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms