Protein–RNA interactions for Protein: P62834

RAP1A, Ras-related protein Rap-1A, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAP1AP62834 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAP1AP62834 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAP1AP62834 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAP1AP62834 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAP1AP62834 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAP1AP62834 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAP1AP62834 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAP1AP62834 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAP1AP62834 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAP1AP62834 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAP1AP62834 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAP1AP62834 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAP1AP62834 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAP1AP62834 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAP1AP62834 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAP1AP62834 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAP1AP62834 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAP1AP62834 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAP1AP62834 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAP1AP62834 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAP1AP62834 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAP1AP62834 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAP1AP62834 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAP1AP62834 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAP1AP62834 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAP1AP62834 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAP1AP62834 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAP1AP62834 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAP1AP62834 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAP1AP62834 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAP1AP62834 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAP1AP62834 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAP1AP62834 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAP1AP62834 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAP1AP62834 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAP1AP62834 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAP1AP62834 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAP1AP62834 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RAP1AP62834 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAP1AP62834 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAP1AP62834 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RAP1AP62834 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RAP1AP62834 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAP1AP62834 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAP1AP62834 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RAP1AP62834 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAP1AP62834 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAP1AP62834 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAP1AP62834 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RAP1AP62834 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAP1AP62834 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAP1AP62834 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAP1AP62834 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAP1AP62834 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAP1AP62834 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAP1AP62834 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAP1AP62834 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAP1AP62834 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RAP1AP62834 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAP1AP62834 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAP1AP62834 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAP1AP62834 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAP1AP62834 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAP1AP62834 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAP1AP62834 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAP1AP62834 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAP1AP62834 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAP1AP62834 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAP1AP62834 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAP1AP62834 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RAP1AP62834 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAP1AP62834 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAP1AP62834 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAP1AP62834 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAP1AP62834 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RAP1AP62834 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RAP1AP62834 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
RAP1AP62834 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAP1AP62834 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
RAP1AP62834 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAP1AP62834 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAP1AP62834 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAP1AP62834 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAP1AP62834 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAP1AP62834 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAP1AP62834 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAP1AP62834 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAP1AP62834 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAP1AP62834 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAP1AP62834 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAP1AP62834 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAP1AP62834 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAP1AP62834 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAP1AP62834 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAP1AP62834 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAP1AP62834 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAP1AP62834 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RAP1AP62834 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAP1AP62834 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAP1AP62834 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms