Protein–RNA interactions for Protein: P62834

RAP1A, Ras-related protein Rap-1A, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAP1AP62834 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
RAP1AP62834 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
RAP1AP62834 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
RAP1AP62834 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RAP1AP62834 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RAP1AP62834 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RAP1AP62834 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RAP1AP62834 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RAP1AP62834 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RAP1AP62834 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RAP1AP62834 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RAP1AP62834 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RAP1AP62834 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RAP1AP62834 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RAP1AP62834 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RAP1AP62834 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RAP1AP62834 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RAP1AP62834 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RAP1AP62834 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RAP1AP62834 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RAP1AP62834 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RAP1AP62834 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RAP1AP62834 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RAP1AP62834 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RAP1AP62834 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAP1AP62834 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAP1AP62834 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RAP1AP62834 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RAP1AP62834 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RAP1AP62834 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RAP1AP62834 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RAP1AP62834 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RAP1AP62834 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RAP1AP62834 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RAP1AP62834 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RAP1AP62834 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RAP1AP62834 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RAP1AP62834 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RAP1AP62834 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RAP1AP62834 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAP1AP62834 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RAP1AP62834 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RAP1AP62834 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RAP1AP62834 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RAP1AP62834 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RAP1AP62834 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RAP1AP62834 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAP1AP62834 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAP1AP62834 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RAP1AP62834 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RAP1AP62834 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RAP1AP62834 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RAP1AP62834 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAP1AP62834 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAP1AP62834 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAP1AP62834 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RAP1AP62834 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RAP1AP62834 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RAP1AP62834 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RAP1AP62834 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAP1AP62834 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAP1AP62834 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RAP1AP62834 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RAP1AP62834 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RAP1AP62834 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RAP1AP62834 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RAP1AP62834 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RAP1AP62834 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RAP1AP62834 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RAP1AP62834 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RAP1AP62834 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAP1AP62834 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAP1AP62834 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RAP1AP62834 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RAP1AP62834 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
RAP1AP62834 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAP1AP62834 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAP1AP62834 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAP1AP62834 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAP1AP62834 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAP1AP62834 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAP1AP62834 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAP1AP62834 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAP1AP62834 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RAP1AP62834 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAP1AP62834 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAP1AP62834 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAP1AP62834 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAP1AP62834 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAP1AP62834 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAP1AP62834 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAP1AP62834 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAP1AP62834 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAP1AP62834 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAP1AP62834 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAP1AP62834 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAP1AP62834 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAP1AP62834 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAP1AP62834 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAP1AP62834 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms