Protein–RNA interactions for Protein: P62820

RAB1A, Ras-related protein Rab-1A, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1AP62820 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB1AP62820 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB1AP62820 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB1AP62820 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB1AP62820 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB1AP62820 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB1AP62820 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB1AP62820 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB1AP62820 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB1AP62820 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB1AP62820 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB1AP62820 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB1AP62820 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB1AP62820 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB1AP62820 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB1AP62820 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB1AP62820 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB1AP62820 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB1AP62820 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB1AP62820 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB1AP62820 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB1AP62820 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB1AP62820 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB1AP62820 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB1AP62820 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB1AP62820 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RAB1AP62820 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
RAB1AP62820 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAB1AP62820 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB1AP62820 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB1AP62820 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB1AP62820 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB1AP62820 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB1AP62820 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB1AP62820 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB1AP62820 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB1AP62820 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB1AP62820 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB1AP62820 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB1AP62820 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB1AP62820 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB1AP62820 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB1AP62820 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB1AP62820 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB1AP62820 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB1AP62820 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB1AP62820 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB1AP62820 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB1AP62820 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB1AP62820 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB1AP62820 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB1AP62820 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB1AP62820 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB1AP62820 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB1AP62820 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB1AP62820 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB1AP62820 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB1AP62820 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB1AP62820 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB1AP62820 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB1AP62820 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB1AP62820 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB1AP62820 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB1AP62820 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB1AP62820 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB1AP62820 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RAB1AP62820 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB1AP62820 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB1AP62820 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB1AP62820 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB1AP62820 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB1AP62820 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB1AP62820 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB1AP62820 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB1AP62820 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB1AP62820 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB1AP62820 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB1AP62820 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB1AP62820 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB1AP62820 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB1AP62820 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB1AP62820 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB1AP62820 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB1AP62820 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB1AP62820 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB1AP62820 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB1AP62820 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB1AP62820 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB1AP62820 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB1AP62820 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB1AP62820 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB1AP62820 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB1AP62820 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB1AP62820 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB1AP62820 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB1AP62820 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB1AP62820 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB1AP62820 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB1AP62820 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB1AP62820 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 311.4 ms