Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVFRD-1P60508 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVFRD-1P60508 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVFRD-1P60508 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVFRD-1P60508 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERVFRD-1P60508 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERVFRD-1P60508 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERVFRD-1P60508 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ERVFRD-1P60508 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ERVFRD-1P60508 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERVFRD-1P60508 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERVFRD-1P60508 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERVFRD-1P60508 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ERVFRD-1P60508 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERVFRD-1P60508 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ERVFRD-1P60508 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERVFRD-1P60508 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERVFRD-1P60508 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERVFRD-1P60508 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERVFRD-1P60508 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERVFRD-1P60508 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERVFRD-1P60508 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERVFRD-1P60508 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERVFRD-1P60508 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERVFRD-1P60508 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERVFRD-1P60508 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERVFRD-1P60508 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ERVFRD-1P60508 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERVFRD-1P60508 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERVFRD-1P60508 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ERVFRD-1P60508 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERVFRD-1P60508 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVFRD-1P60508 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVFRD-1P60508 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERVFRD-1P60508 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERVFRD-1P60508 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERVFRD-1P60508 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERVFRD-1P60508 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERVFRD-1P60508 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERVFRD-1P60508 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERVFRD-1P60508 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERVFRD-1P60508 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVFRD-1P60508 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVFRD-1P60508 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVFRD-1P60508 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVFRD-1P60508 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVFRD-1P60508 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVFRD-1P60508 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVFRD-1P60508 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERVFRD-1P60508 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVFRD-1P60508 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVFRD-1P60508 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVFRD-1P60508 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVFRD-1P60508 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVFRD-1P60508 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVFRD-1P60508 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVFRD-1P60508 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVFRD-1P60508 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVFRD-1P60508 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVFRD-1P60508 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVFRD-1P60508 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVFRD-1P60508 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVFRD-1P60508 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVFRD-1P60508 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVFRD-1P60508 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVFRD-1P60508 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVFRD-1P60508 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVFRD-1P60508 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVFRD-1P60508 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVFRD-1P60508 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVFRD-1P60508 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVFRD-1P60508 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVFRD-1P60508 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVFRD-1P60508 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVFRD-1P60508 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVFRD-1P60508 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVFRD-1P60508 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVFRD-1P60508 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVFRD-1P60508 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVFRD-1P60508 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVFRD-1P60508 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVFRD-1P60508 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVFRD-1P60508 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVFRD-1P60508 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVFRD-1P60508 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVFRD-1P60508 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVFRD-1P60508 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVFRD-1P60508 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVFRD-1P60508 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVFRD-1P60508 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVFRD-1P60508 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVFRD-1P60508 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVFRD-1P60508 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVFRD-1P60508 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVFRD-1P60508 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVFRD-1P60508 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVFRD-1P60508 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVFRD-1P60508 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVFRD-1P60508 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVFRD-1P60508 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.1 ms