Protein–RNA interactions for Protein: P59826

BPIFB3, BPI fold-containing family B member 3, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFB3P59826 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
BPIFB3P59826 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BPIFB3P59826 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BPIFB3P59826 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BPIFB3P59826 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BPIFB3P59826 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BPIFB3P59826 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BPIFB3P59826 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BPIFB3P59826 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BPIFB3P59826 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BPIFB3P59826 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BPIFB3P59826 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BPIFB3P59826 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BPIFB3P59826 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BPIFB3P59826 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
BPIFB3P59826 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BPIFB3P59826 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BPIFB3P59826 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
BPIFB3P59826 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BPIFB3P59826 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BPIFB3P59826 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BPIFB3P59826 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BPIFB3P59826 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BPIFB3P59826 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BPIFB3P59826 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BPIFB3P59826 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BPIFB3P59826 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BPIFB3P59826 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BPIFB3P59826 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BPIFB3P59826 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BPIFB3P59826 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BPIFB3P59826 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BPIFB3P59826 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BPIFB3P59826 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
BPIFB3P59826 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BPIFB3P59826 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
BPIFB3P59826 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BPIFB3P59826 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BPIFB3P59826 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BPIFB3P59826 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BPIFB3P59826 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BPIFB3P59826 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BPIFB3P59826 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BPIFB3P59826 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BPIFB3P59826 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BPIFB3P59826 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BPIFB3P59826 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BPIFB3P59826 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BPIFB3P59826 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BPIFB3P59826 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BPIFB3P59826 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BPIFB3P59826 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BPIFB3P59826 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BPIFB3P59826 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BPIFB3P59826 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BPIFB3P59826 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BPIFB3P59826 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BPIFB3P59826 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BPIFB3P59826 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BPIFB3P59826 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BPIFB3P59826 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BPIFB3P59826 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BPIFB3P59826 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BPIFB3P59826 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BPIFB3P59826 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BPIFB3P59826 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BPIFB3P59826 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BPIFB3P59826 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BPIFB3P59826 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BPIFB3P59826 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BPIFB3P59826 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BPIFB3P59826 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BPIFB3P59826 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BPIFB3P59826 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BPIFB3P59826 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BPIFB3P59826 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BPIFB3P59826 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BPIFB3P59826 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BPIFB3P59826 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BPIFB3P59826 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BPIFB3P59826 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BPIFB3P59826 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BPIFB3P59826 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BPIFB3P59826 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BPIFB3P59826 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BPIFB3P59826 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BPIFB3P59826 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BPIFB3P59826 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BPIFB3P59826 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BPIFB3P59826 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BPIFB3P59826 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BPIFB3P59826 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BPIFB3P59826 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BPIFB3P59826 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BPIFB3P59826 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BPIFB3P59826 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BPIFB3P59826 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BPIFB3P59826 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BPIFB3P59826 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BPIFB3P59826 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 582.8 ms