Protein–RNA interactions for Protein: P58304

VSX2, Visual system homeobox 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSX2P58304 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VSX2P58304 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VSX2P58304 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VSX2P58304 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VSX2P58304 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VSX2P58304 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VSX2P58304 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VSX2P58304 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VSX2P58304 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
VSX2P58304 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
VSX2P58304 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VSX2P58304 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VSX2P58304 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VSX2P58304 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VSX2P58304 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VSX2P58304 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VSX2P58304 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VSX2P58304 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VSX2P58304 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VSX2P58304 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
VSX2P58304 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
VSX2P58304 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VSX2P58304 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VSX2P58304 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VSX2P58304 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VSX2P58304 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VSX2P58304 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VSX2P58304 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VSX2P58304 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
VSX2P58304 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
VSX2P58304 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
VSX2P58304 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VSX2P58304 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VSX2P58304 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VSX2P58304 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VSX2P58304 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VSX2P58304 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VSX2P58304 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VSX2P58304 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VSX2P58304 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
VSX2P58304 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VSX2P58304 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VSX2P58304 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VSX2P58304 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VSX2P58304 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
VSX2P58304 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
VSX2P58304 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
VSX2P58304 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VSX2P58304 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VSX2P58304 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VSX2P58304 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VSX2P58304 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VSX2P58304 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
VSX2P58304 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VSX2P58304 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VSX2P58304 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VSX2P58304 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
VSX2P58304 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VSX2P58304 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VSX2P58304 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VSX2P58304 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VSX2P58304 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
VSX2P58304 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VSX2P58304 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
VSX2P58304 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VSX2P58304 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
VSX2P58304 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
VSX2P58304 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VSX2P58304 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VSX2P58304 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
VSX2P58304 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VSX2P58304 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VSX2P58304 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VSX2P58304 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VSX2P58304 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VSX2P58304 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VSX2P58304 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VSX2P58304 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VSX2P58304 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VSX2P58304 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VSX2P58304 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
VSX2P58304 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VSX2P58304 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VSX2P58304 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VSX2P58304 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
VSX2P58304 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VSX2P58304 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VSX2P58304 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VSX2P58304 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VSX2P58304 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
VSX2P58304 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VSX2P58304 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VSX2P58304 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VSX2P58304 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VSX2P58304 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VSX2P58304 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VSX2P58304 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VSX2P58304 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VSX2P58304 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VSX2P58304 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.8 ms