Protein–RNA interactions for Protein: P57103

SLC8A3, Sodium/calcium exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 927 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A3P57103 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
SLC8A3P57103 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLC8A3P57103 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SLC8A3P57103 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SLC8A3P57103 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLC8A3P57103 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLC8A3P57103 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SLC8A3P57103 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SLC8A3P57103 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SLC8A3P57103 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SLC8A3P57103 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SLC8A3P57103 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SLC8A3P57103 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC8A3P57103 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLC8A3P57103 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SLC8A3P57103 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SLC8A3P57103 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
SLC8A3P57103 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLC8A3P57103 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLC8A3P57103 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SLC8A3P57103 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SLC8A3P57103 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SLC8A3P57103 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SLC8A3P57103 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLC8A3P57103 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLC8A3P57103 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
SLC8A3P57103 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SLC8A3P57103 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SLC8A3P57103 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SLC8A3P57103 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SLC8A3P57103 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLC8A3P57103 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLC8A3P57103 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLC8A3P57103 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SLC8A3P57103 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SLC8A3P57103 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SLC8A3P57103 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SLC8A3P57103 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SLC8A3P57103 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SLC8A3P57103 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SLC8A3P57103 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SLC8A3P57103 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SLC8A3P57103 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SLC8A3P57103 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SLC8A3P57103 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
SLC8A3P57103 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SLC8A3P57103 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SLC8A3P57103 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLC8A3P57103 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLC8A3P57103 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLC8A3P57103 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLC8A3P57103 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SLC8A3P57103 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SLC8A3P57103 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SLC8A3P57103 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SLC8A3P57103 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SLC8A3P57103 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLC8A3P57103 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC8A3P57103 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
SLC8A3P57103 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC8A3P57103 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLC8A3P57103 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC8A3P57103 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC8A3P57103 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC8A3P57103 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SLC8A3P57103 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SLC8A3P57103 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLC8A3P57103 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SLC8A3P57103 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SLC8A3P57103 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SLC8A3P57103 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SLC8A3P57103 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SLC8A3P57103 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLC8A3P57103 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLC8A3P57103 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC8A3P57103 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLC8A3P57103 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLC8A3P57103 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC8A3P57103 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC8A3P57103 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC8A3P57103 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC8A3P57103 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC8A3P57103 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SLC8A3P57103 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SLC8A3P57103 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SLC8A3P57103 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SLC8A3P57103 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLC8A3P57103 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLC8A3P57103 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SLC8A3P57103 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLC8A3P57103 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLC8A3P57103 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLC8A3P57103 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLC8A3P57103 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC8A3P57103 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC8A3P57103 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC8A3P57103 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC8A3P57103 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC8A3P57103 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC8A3P57103 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms