Protein–RNA interactions for Protein: P54845

NRL, Neural retina-specific leucine zipper protein, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRLP54845 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NRLP54845 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NRLP54845 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NRLP54845 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NRLP54845 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NRLP54845 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NRLP54845 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NRLP54845 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NRLP54845 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NRLP54845 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NRLP54845 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
NRLP54845 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NRLP54845 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NRLP54845 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NRLP54845 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NRLP54845 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NRLP54845 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NRLP54845 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NRLP54845 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NRLP54845 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NRLP54845 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NRLP54845 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NRLP54845 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
NRLP54845 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
NRLP54845 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
NRLP54845 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NRLP54845 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NRLP54845 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NRLP54845 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
NRLP54845 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NRLP54845 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NRLP54845 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NRLP54845 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NRLP54845 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NRLP54845 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NRLP54845 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NRLP54845 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NRLP54845 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NRLP54845 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NRLP54845 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NRLP54845 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NRLP54845 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NRLP54845 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NRLP54845 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NRLP54845 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
NRLP54845 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NRLP54845 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NRLP54845 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NRLP54845 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NRLP54845 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NRLP54845 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NRLP54845 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NRLP54845 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NRLP54845 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NRLP54845 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NRLP54845 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NRLP54845 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NRLP54845 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NRLP54845 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NRLP54845 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NRLP54845 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
NRLP54845 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NRLP54845 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NRLP54845 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NRLP54845 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NRLP54845 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NRLP54845 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NRLP54845 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
NRLP54845 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NRLP54845 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NRLP54845 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NRLP54845 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NRLP54845 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NRLP54845 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
NRLP54845 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NRLP54845 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NRLP54845 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
NRLP54845 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NRLP54845 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NRLP54845 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NRLP54845 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NRLP54845 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NRLP54845 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NRLP54845 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NRLP54845 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NRLP54845 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NRLP54845 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
NRLP54845 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NRLP54845 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NRLP54845 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NRLP54845 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NRLP54845 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NRLP54845 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NRLP54845 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NRLP54845 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NRLP54845 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NRLP54845 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NRLP54845 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
NRLP54845 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
NRLP54845 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms