Protein–RNA interactions for Protein: P54709

ATP1B3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1B3P54709 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP1B3P54709 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP1B3P54709 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP1B3P54709 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP1B3P54709 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP1B3P54709 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP1B3P54709 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP1B3P54709 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP1B3P54709 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP1B3P54709 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP1B3P54709 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP1B3P54709 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP1B3P54709 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP1B3P54709 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP1B3P54709 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP1B3P54709 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP1B3P54709 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP1B3P54709 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP1B3P54709 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP1B3P54709 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP1B3P54709 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP1B3P54709 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP1B3P54709 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP1B3P54709 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP1B3P54709 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP1B3P54709 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP1B3P54709 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP1B3P54709 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP1B3P54709 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP1B3P54709 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP1B3P54709 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP1B3P54709 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP1B3P54709 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP1B3P54709 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP1B3P54709 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP1B3P54709 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP1B3P54709 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP1B3P54709 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP1B3P54709 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP1B3P54709 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP1B3P54709 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP1B3P54709 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP1B3P54709 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP1B3P54709 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP1B3P54709 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP1B3P54709 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP1B3P54709 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP1B3P54709 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP1B3P54709 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP1B3P54709 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP1B3P54709 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP1B3P54709 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP1B3P54709 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP1B3P54709 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP1B3P54709 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP1B3P54709 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP1B3P54709 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP1B3P54709 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP1B3P54709 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP1B3P54709 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP1B3P54709 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP1B3P54709 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP1B3P54709 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP1B3P54709 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP1B3P54709 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP1B3P54709 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP1B3P54709 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP1B3P54709 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP1B3P54709 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP1B3P54709 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP1B3P54709 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP1B3P54709 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP1B3P54709 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP1B3P54709 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP1B3P54709 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP1B3P54709 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP1B3P54709 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP1B3P54709 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP1B3P54709 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP1B3P54709 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP1B3P54709 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP1B3P54709 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP1B3P54709 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP1B3P54709 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP1B3P54709 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP1B3P54709 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP1B3P54709 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP1B3P54709 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP1B3P54709 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP1B3P54709 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP1B3P54709 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP1B3P54709 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP1B3P54709 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP1B3P54709 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP1B3P54709 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP1B3P54709 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP1B3P54709 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP1B3P54709 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP1B3P54709 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP1B3P54709 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms