Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CACNB3P54284 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CACNB3P54284 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
CACNB3P54284 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
CACNB3P54284 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
CACNB3P54284 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
CACNB3P54284 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
CACNB3P54284 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CACNB3P54284 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CACNB3P54284 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CACNB3P54284 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CACNB3P54284 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
CACNB3P54284 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CACNB3P54284 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CACNB3P54284 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CACNB3P54284 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CACNB3P54284 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CACNB3P54284 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CACNB3P54284 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CACNB3P54284 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CACNB3P54284 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CACNB3P54284 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CACNB3P54284 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CACNB3P54284 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CACNB3P54284 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CACNB3P54284 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
CACNB3P54284 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
CACNB3P54284 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CACNB3P54284 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CACNB3P54284 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
CACNB3P54284 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
CACNB3P54284 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
CACNB3P54284 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
CACNB3P54284 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
CACNB3P54284 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CACNB3P54284 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CACNB3P54284 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CACNB3P54284 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CACNB3P54284 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
CACNB3P54284 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
CACNB3P54284 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
CACNB3P54284 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
CACNB3P54284 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
CACNB3P54284 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
CACNB3P54284 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
CACNB3P54284 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
CACNB3P54284 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
CACNB3P54284 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
CACNB3P54284 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CACNB3P54284 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CACNB3P54284 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
CACNB3P54284 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC32.48■■■□□ 2.79
CACNB3P54284 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
CACNB3P54284 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
CACNB3P54284 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CACNB3P54284 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
CACNB3P54284 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
CACNB3P54284 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
CACNB3P54284 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
CACNB3P54284 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CACNB3P54284 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CACNB3P54284 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CACNB3P54284 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CACNB3P54284 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CACNB3P54284 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
CACNB3P54284 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CACNB3P54284 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CACNB3P54284 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CACNB3P54284 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CACNB3P54284 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CACNB3P54284 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CACNB3P54284 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CACNB3P54284 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CACNB3P54284 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CACNB3P54284 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CACNB3P54284 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CACNB3P54284 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CACNB3P54284 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CACNB3P54284 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CACNB3P54284 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CACNB3P54284 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CACNB3P54284 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CACNB3P54284 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CACNB3P54284 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CACNB3P54284 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CACNB3P54284 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CACNB3P54284 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC32.3■■■□□ 2.76
CACNB3P54284 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CACNB3P54284 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
CACNB3P54284 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
CACNB3P54284 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CACNB3P54284 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CACNB3P54284 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CACNB3P54284 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CACNB3P54284 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CACNB3P54284 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
CACNB3P54284 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CACNB3P54284 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CACNB3P54284 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CACNB3P54284 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.8 ms