Protein–RNA interactions for Protein: P54277

PMS1, PMS1 protein homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1P54277 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PMS1P54277 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PMS1P54277 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PMS1P54277 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PMS1P54277 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PMS1P54277 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PMS1P54277 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PMS1P54277 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PMS1P54277 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PMS1P54277 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PMS1P54277 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
PMS1P54277 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PMS1P54277 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
PMS1P54277 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PMS1P54277 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PMS1P54277 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PMS1P54277 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PMS1P54277 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PMS1P54277 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PMS1P54277 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PMS1P54277 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PMS1P54277 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PMS1P54277 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PMS1P54277 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PMS1P54277 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PMS1P54277 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
PMS1P54277 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PMS1P54277 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PMS1P54277 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PMS1P54277 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PMS1P54277 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PMS1P54277 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PMS1P54277 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PMS1P54277 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PMS1P54277 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PMS1P54277 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PMS1P54277 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PMS1P54277 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PMS1P54277 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PMS1P54277 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PMS1P54277 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PMS1P54277 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PMS1P54277 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PMS1P54277 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PMS1P54277 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PMS1P54277 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PMS1P54277 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PMS1P54277 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PMS1P54277 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PMS1P54277 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PMS1P54277 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PMS1P54277 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PMS1P54277 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PMS1P54277 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PMS1P54277 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PMS1P54277 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PMS1P54277 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PMS1P54277 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PMS1P54277 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PMS1P54277 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PMS1P54277 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PMS1P54277 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PMS1P54277 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PMS1P54277 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PMS1P54277 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
PMS1P54277 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PMS1P54277 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PMS1P54277 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PMS1P54277 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
PMS1P54277 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PMS1P54277 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PMS1P54277 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PMS1P54277 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PMS1P54277 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PMS1P54277 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PMS1P54277 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PMS1P54277 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PMS1P54277 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PMS1P54277 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PMS1P54277 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PMS1P54277 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
PMS1P54277 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
PMS1P54277 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
PMS1P54277 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PMS1P54277 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PMS1P54277 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PMS1P54277 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PMS1P54277 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PMS1P54277 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PMS1P54277 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PMS1P54277 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PMS1P54277 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PMS1P54277 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PMS1P54277 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PMS1P54277 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PMS1P54277 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PMS1P54277 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PMS1P54277 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
PMS1P54277 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PMS1P54277 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms