Protein–RNA interactions for Protein: P53999

SUB1, Activated RNA polymerase II transcriptional coactivator p15, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUB1P53999 TRA2B-215ENST00000492417 4141 ntTSL 1 (best)3.69□□□□□ -1.823e-14■■■■■ 92.8
SUB1P53999 TRA2B-201ENST00000259043 943 ntTSL 33.23□□□□□ -1.893e-14■■■■■ 92.8
SUB1P53999 ACTG1-207ENST00000574671 1678 ntTSL 1 (best)10.29□□□□□ -0.766e-46■■■■■ 92.6
SUB1P53999 MMS19-218ENST00000485400 1513 ntTSL 211.79□□□□□ -0.527e-7■■■■■ 91.9
SUB1P53999 MMS19-212ENST00000444411 640 ntTSL 211.23□□□□□ -0.617e-7■■■■■ 91.9
SUB1P53999 MMS19-219ENST00000495415 1879 ntTSL 510.02□□□□□ -0.817e-7■■■■■ 91.9
SUB1P53999 MMS19-207ENST00000434538 2164 ntTSL 29.56□□□□□ -0.887e-7■■■■■ 91.9
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SUB1P53999 PRDX1-202ENST00000319248 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.741e-34■■■■■ 91.5
SUB1P53999 PRDX1-203ENST00000372079 609 ntTSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.021e-34■■■■■ 91.5
SUB1P53999 TRMT112-204ENST00000537918 559 ntTSL 1 (best)14.18□□□□□ -0.143e-12■■■■■ 91
SUB1P53999 HIST1H3A-201ENST00000613854 411 ntAPPRIS P1 BASIC8.35□□□□□ -1.075e-19■■■■■ 90.8
SUB1P53999 DHX15-201ENST00000336812 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.982e-12■■■■■ 90.4
SUB1P53999 DHX15-206ENST00000510645 470 ntTSL 54.81□□□□□ -1.642e-12■■■■■ 90.4
SUB1P53999 DHX15-209ENST00000513036 1848 ntTSL 24.8□□□□□ -1.642e-12■■■■■ 90.4
SUB1P53999 DHX15-204ENST00000508032 3028 ntTSL 1 (best)3.17□□□□□ -1.92e-12■■■■■ 90.4
SUB1P53999 DHX15-208ENST00000512903 2071 ntTSL 22.8□□□□□ -1.962e-12■■■■■ 90.4
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SUB1P53999 DNMT1-201ENST00000340748 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.572e-11■■■■■ 90.2
SUB1P53999 DNMT1-228ENST00000592705 5215 ntTSL 1 (best)11.23□□□□□ -0.612e-11■■■■■ 90.2
SUB1P53999 DNMT1-203ENST00000540357 4916 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.612e-11■■■■■ 90.2
SUB1P53999 DNMT1-207ENST00000586588 3094 ntTSL 210.47□□□□□ -0.732e-11■■■■■ 90.2
SUB1P53999 DNMT1-225ENST00000591798 521 ntTSL 36.04□□□□□ -1.442e-11■■■■■ 90.2
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SUB1P53999 ATP5A1-202ENST00000398752 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.985e-8■■■■■ 89.7
SUB1P53999 DHX9-202ENST00000473076 1378 ntTSL 1 (best)10.67□□□□□ -0.74e-8■■■■■ 89.7
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SUB1P53999 DHX9-201ENST00000367549 4240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.124e-8■■■■■ 89.7
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SUB1P53999 CCT5-201ENST00000280326 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.411e-6■■■■■ 87.9
SUB1P53999 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.845e-10■■■■■ 87.8
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SUB1P53999 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.661e-323■■■■■ 87.7
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SUB1P53999 HDDC2-208ENST00000609021 3529 nt3.73□□□□□ -1.811e-323■■■■■ 87.7
SUB1P53999 RPL35A-207ENST00000474640 687 ntTSL 25.48□□□□□ -1.535e-14■■■■■ 87.4
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SUB1P53999 HIGD2A-201ENST00000274787 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.781e-11■■■■■ 86.9
SUB1P53999 HIST1H4D-201ENST00000614247 312 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.161e-323■■■■■ 86.8
SUB1P53999 AP2S1-208ENST00000600964 458 ntTSL 1 (best)13.26□□□□□ -0.292e-53■■■■■ 86.7
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SUB1P53999 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.115e-17■■■■■ 86.3
SUB1P53999 ME2-203ENST00000585680 1792 ntTSL 55.02□□□□□ -1.615e-17■■■■■ 86.3
SUB1P53999 ME2-205ENST00000591925 2092 ntTSL 24.47□□□□□ -1.695e-17■■■■■ 86.3
SUB1P53999 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.241e-323■■■■■ 85.9
SUB1P53999 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.323e-11■■■■■ 85.4
SUB1P53999 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.463e-11■■■■■ 85.4
SUB1P53999 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.923e-11■■■■■ 85.4
SUB1P53999 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.172e-9■■■■■ 85.1
SUB1P53999 PSMA1-201ENST00000396394 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.792e-9■■■■■ 85.1
SUB1P53999 AC018523.2-201ENST00000555531 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.762e-9■■■■■ 85.1
SUB1P53999 PSMA1-207ENST00000528307 1394 ntTSL 53.28□□□□□ -1.882e-9■■■■■ 85.1
SUB1P53999 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.291e-13■■■■■ 84.9
SUB1P53999 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -03e-18■■■■■ 84.9
SUB1P53999 MIB1-204ENST00000578646 3306 ntTSL 28.97□□□□□ -0.973e-18■■■■■ 84.9
SUB1P53999 THOC2-209ENST00000448128 1365 ntTSL 55.06□□□□□ -1.63e-18■■■■■ 84.9
SUB1P53999 THOC2-217ENST00000492203 641 ntTSL 33.91□□□□□ -1.783e-18■■■■■ 84.9
SUB1P53999 THOC2-208ENST00000441692 4364 ntTSL 53.09□□□□□ -1.923e-18■■■■■ 84.9
SUB1P53999 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.963e-18■■■■■ 84.9
SUB1P53999 NUP107-205ENST00000535718 2655 ntTSL 1 (best)8.56□□□□□ -1.041e-9■■■■■ 84.6
SUB1P53999 NUP107-201ENST00000229179 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.161e-9■■■■■ 84.6
SUB1P53999 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.761e-9■■■■■ 84.6
SUB1P53999 ATP5A1-217ENST00000591981 565 ntTSL 411.14□□□□□ -0.631e-9■■■■■ 84.5
SUB1P53999 ATP5A1-214ENST00000590448 604 ntTSL 29.21□□□□□ -0.941e-9■■■■■ 84.5
SUB1P53999 ATP5A1-219ENST00000592989 553 ntTSL 58.09□□□□□ -1.111e-9■■■■■ 84.5
SUB1P53999 STRAP-202ENST00000419869 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.714e-7■■■■■ 84.4
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