Protein–RNA interactions for Protein: P52926

HMGA2, High mobility group protein HMGI-C, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGA2P52926 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HMGA2P52926 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HMGA2P52926 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HMGA2P52926 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HMGA2P52926 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HMGA2P52926 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HMGA2P52926 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HMGA2P52926 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HMGA2P52926 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HMGA2P52926 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HMGA2P52926 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HMGA2P52926 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HMGA2P52926 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HMGA2P52926 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HMGA2P52926 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HMGA2P52926 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HMGA2P52926 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HMGA2P52926 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HMGA2P52926 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HMGA2P52926 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HMGA2P52926 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HMGA2P52926 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HMGA2P52926 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HMGA2P52926 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HMGA2P52926 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HMGA2P52926 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HMGA2P52926 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HMGA2P52926 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HMGA2P52926 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
HMGA2P52926 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HMGA2P52926 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HMGA2P52926 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HMGA2P52926 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HMGA2P52926 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HMGA2P52926 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HMGA2P52926 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HMGA2P52926 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HMGA2P52926 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
HMGA2P52926 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HMGA2P52926 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HMGA2P52926 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HMGA2P52926 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HMGA2P52926 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HMGA2P52926 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HMGA2P52926 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
HMGA2P52926 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HMGA2P52926 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HMGA2P52926 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HMGA2P52926 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HMGA2P52926 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HMGA2P52926 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HMGA2P52926 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HMGA2P52926 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HMGA2P52926 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HMGA2P52926 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HMGA2P52926 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HMGA2P52926 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HMGA2P52926 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HMGA2P52926 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
HMGA2P52926 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HMGA2P52926 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HMGA2P52926 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HMGA2P52926 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HMGA2P52926 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HMGA2P52926 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
HMGA2P52926 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HMGA2P52926 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HMGA2P52926 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HMGA2P52926 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HMGA2P52926 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HMGA2P52926 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HMGA2P52926 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HMGA2P52926 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HMGA2P52926 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HMGA2P52926 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HMGA2P52926 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HMGA2P52926 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HMGA2P52926 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HMGA2P52926 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HMGA2P52926 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HMGA2P52926 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HMGA2P52926 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HMGA2P52926 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HMGA2P52926 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HMGA2P52926 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
HMGA2P52926 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HMGA2P52926 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HMGA2P52926 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HMGA2P52926 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HMGA2P52926 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HMGA2P52926 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
HMGA2P52926 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HMGA2P52926 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HMGA2P52926 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HMGA2P52926 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HMGA2P52926 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HMGA2P52926 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HMGA2P52926 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HMGA2P52926 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMGA2P52926 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms