Protein–RNA interactions for Protein: P52790

HK3, Hexokinase-3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HK3P52790 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HK3P52790 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HK3P52790 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HK3P52790 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HK3P52790 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HK3P52790 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HK3P52790 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HK3P52790 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HK3P52790 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HK3P52790 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HK3P52790 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HK3P52790 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HK3P52790 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HK3P52790 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
HK3P52790 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
HK3P52790 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
HK3P52790 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HK3P52790 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HK3P52790 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HK3P52790 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HK3P52790 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HK3P52790 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HK3P52790 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HK3P52790 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HK3P52790 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HK3P52790 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HK3P52790 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HK3P52790 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HK3P52790 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
HK3P52790 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HK3P52790 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HK3P52790 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HK3P52790 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HK3P52790 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HK3P52790 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HK3P52790 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HK3P52790 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HK3P52790 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
HK3P52790 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HK3P52790 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
HK3P52790 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
HK3P52790 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HK3P52790 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HK3P52790 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HK3P52790 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HK3P52790 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HK3P52790 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HK3P52790 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HK3P52790 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HK3P52790 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HK3P52790 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HK3P52790 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HK3P52790 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HK3P52790 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HK3P52790 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HK3P52790 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HK3P52790 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HK3P52790 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HK3P52790 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HK3P52790 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HK3P52790 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HK3P52790 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
HK3P52790 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HK3P52790 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HK3P52790 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HK3P52790 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
HK3P52790 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HK3P52790 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HK3P52790 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HK3P52790 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
HK3P52790 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HK3P52790 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HK3P52790 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HK3P52790 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HK3P52790 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HK3P52790 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HK3P52790 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HK3P52790 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HK3P52790 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HK3P52790 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HK3P52790 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HK3P52790 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
HK3P52790 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HK3P52790 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
HK3P52790 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HK3P52790 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HK3P52790 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HK3P52790 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HK3P52790 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HK3P52790 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HK3P52790 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HK3P52790 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HK3P52790 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HK3P52790 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HK3P52790 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HK3P52790 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HK3P52790 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
HK3P52790 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HK3P52790 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HK3P52790 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms