Protein–RNA interactions for Protein: P52788

SMS, Spermine synthase, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMSP52788 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMSP52788 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMSP52788 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMSP52788 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMSP52788 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMSP52788 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMSP52788 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMSP52788 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMSP52788 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMSP52788 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMSP52788 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMSP52788 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMSP52788 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMSP52788 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMSP52788 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMSP52788 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMSP52788 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMSP52788 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SMSP52788 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SMSP52788 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMSP52788 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMSP52788 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMSP52788 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMSP52788 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMSP52788 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMSP52788 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMSP52788 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SMSP52788 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMSP52788 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMSP52788 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMSP52788 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMSP52788 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMSP52788 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMSP52788 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SMSP52788 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SMSP52788 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMSP52788 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMSP52788 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMSP52788 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMSP52788 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMSP52788 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMSP52788 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMSP52788 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMSP52788 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMSP52788 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMSP52788 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SMSP52788 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMSP52788 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMSP52788 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMSP52788 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SMSP52788 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMSP52788 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMSP52788 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMSP52788 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMSP52788 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMSP52788 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMSP52788 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMSP52788 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMSP52788 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMSP52788 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMSP52788 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMSP52788 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMSP52788 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMSP52788 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SMSP52788 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMSP52788 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMSP52788 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMSP52788 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMSP52788 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMSP52788 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SMSP52788 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SMSP52788 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMSP52788 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMSP52788 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMSP52788 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMSP52788 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMSP52788 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMSP52788 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMSP52788 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMSP52788 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMSP52788 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SMSP52788 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMSP52788 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMSP52788 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMSP52788 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMSP52788 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMSP52788 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMSP52788 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMSP52788 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMSP52788 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMSP52788 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMSP52788 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMSP52788 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMSP52788 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMSP52788 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMSP52788 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMSP52788 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SMSP52788 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMSP52788 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMSP52788 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms