Protein–RNA interactions for Protein: P52306

RAP1GDS1, Rap1 GTPase-GDP dissociation stimulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAP1GDS1P52306 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RAP1GDS1P52306 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RAP1GDS1P52306 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAP1GDS1P52306 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAP1GDS1P52306 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RAP1GDS1P52306 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RAP1GDS1P52306 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RAP1GDS1P52306 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
RAP1GDS1P52306 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RAP1GDS1P52306 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RAP1GDS1P52306 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RAP1GDS1P52306 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RAP1GDS1P52306 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RAP1GDS1P52306 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RAP1GDS1P52306 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RAP1GDS1P52306 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RAP1GDS1P52306 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RAP1GDS1P52306 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RAP1GDS1P52306 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RAP1GDS1P52306 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RAP1GDS1P52306 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RAP1GDS1P52306 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RAP1GDS1P52306 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAP1GDS1P52306 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAP1GDS1P52306 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAP1GDS1P52306 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAP1GDS1P52306 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAP1GDS1P52306 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RAP1GDS1P52306 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RAP1GDS1P52306 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RAP1GDS1P52306 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAP1GDS1P52306 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAP1GDS1P52306 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAP1GDS1P52306 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAP1GDS1P52306 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAP1GDS1P52306 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RAP1GDS1P52306 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RAP1GDS1P52306 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RAP1GDS1P52306 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RAP1GDS1P52306 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RAP1GDS1P52306 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
RAP1GDS1P52306 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RAP1GDS1P52306 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RAP1GDS1P52306 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RAP1GDS1P52306 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAP1GDS1P52306 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAP1GDS1P52306 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
RAP1GDS1P52306 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RAP1GDS1P52306 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAP1GDS1P52306 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAP1GDS1P52306 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAP1GDS1P52306 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAP1GDS1P52306 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAP1GDS1P52306 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAP1GDS1P52306 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RAP1GDS1P52306 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RAP1GDS1P52306 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RAP1GDS1P52306 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RAP1GDS1P52306 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RAP1GDS1P52306 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RAP1GDS1P52306 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RAP1GDS1P52306 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RAP1GDS1P52306 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RAP1GDS1P52306 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RAP1GDS1P52306 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RAP1GDS1P52306 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RAP1GDS1P52306 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RAP1GDS1P52306 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RAP1GDS1P52306 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAP1GDS1P52306 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAP1GDS1P52306 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RAP1GDS1P52306 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RAP1GDS1P52306 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RAP1GDS1P52306 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RAP1GDS1P52306 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RAP1GDS1P52306 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RAP1GDS1P52306 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RAP1GDS1P52306 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RAP1GDS1P52306 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RAP1GDS1P52306 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RAP1GDS1P52306 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RAP1GDS1P52306 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RAP1GDS1P52306 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RAP1GDS1P52306 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RAP1GDS1P52306 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RAP1GDS1P52306 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RAP1GDS1P52306 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RAP1GDS1P52306 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RAP1GDS1P52306 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RAP1GDS1P52306 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAP1GDS1P52306 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAP1GDS1P52306 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RAP1GDS1P52306 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RAP1GDS1P52306 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAP1GDS1P52306 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAP1GDS1P52306 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAP1GDS1P52306 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RAP1GDS1P52306 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RAP1GDS1P52306 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RAP1GDS1P52306 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms