Protein–RNA interactions for Protein: P51512

MMP16, Matrix metalloproteinase-16, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP16P51512 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MMP16P51512 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MMP16P51512 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MMP16P51512 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MMP16P51512 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MMP16P51512 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MMP16P51512 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MMP16P51512 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MMP16P51512 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MMP16P51512 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MMP16P51512 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MMP16P51512 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MMP16P51512 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MMP16P51512 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MMP16P51512 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MMP16P51512 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MMP16P51512 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MMP16P51512 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
MMP16P51512 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MMP16P51512 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MMP16P51512 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MMP16P51512 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MMP16P51512 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MMP16P51512 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MMP16P51512 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MMP16P51512 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MMP16P51512 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MMP16P51512 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MMP16P51512 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MMP16P51512 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MMP16P51512 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MMP16P51512 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MMP16P51512 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MMP16P51512 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MMP16P51512 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MMP16P51512 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MMP16P51512 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MMP16P51512 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MMP16P51512 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MMP16P51512 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MMP16P51512 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MMP16P51512 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MMP16P51512 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MMP16P51512 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MMP16P51512 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MMP16P51512 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MMP16P51512 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MMP16P51512 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MMP16P51512 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MMP16P51512 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MMP16P51512 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MMP16P51512 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MMP16P51512 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MMP16P51512 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MMP16P51512 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MMP16P51512 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MMP16P51512 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MMP16P51512 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MMP16P51512 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MMP16P51512 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MMP16P51512 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MMP16P51512 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MMP16P51512 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MMP16P51512 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MMP16P51512 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MMP16P51512 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MMP16P51512 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MMP16P51512 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MMP16P51512 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MMP16P51512 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MMP16P51512 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MMP16P51512 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MMP16P51512 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MMP16P51512 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MMP16P51512 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MMP16P51512 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MMP16P51512 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MMP16P51512 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MMP16P51512 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MMP16P51512 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMP16P51512 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MMP16P51512 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMP16P51512 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MMP16P51512 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MMP16P51512 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MMP16P51512 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MMP16P51512 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MMP16P51512 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMP16P51512 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMP16P51512 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMP16P51512 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMP16P51512 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMP16P51512 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMP16P51512 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP16P51512 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP16P51512 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MMP16P51512 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MMP16P51512 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP16P51512 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP16P51512 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.4 ms